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      從食品樣品中分離細(xì)菌病原體DNA

      為什么科學(xué)家需要擴(kuò)增細(xì)菌DNA用于分子鑒定和食源性病原體的血清分型?識別微生物在許多行業(yè)中都非常重要,并且通常被視為質(zhì)量保證,以確保所生產(chǎn)的食品或使用的成分不含有食源性細(xì)菌。許多州和國家還要求對特定物種進(jìn)行檢測,例如沙門氏菌,李斯特菌和大腸桿菌。

      從食品樣品中分離細(xì)菌病原體DNA

      病原體概覽圖像

      傳統(tǒng)上,識別微生物的方法使用差異培養(yǎng)基。這些是需要孵化的固態(tài)培養(yǎng)基,有時需要孵育,有時需要長達(dá)48小時。這可能導(dǎo)致識別食物樣品中可能存在的微生物的嚴(yán)重延遲。使用分子技術(shù),尤其是基于擴(kuò)增的方法,如終點(diǎn)PCR或qPCR,可以提供更快的結(jié)果,從而可以在數(shù)小時而不是數(shù)天內(nèi)做出決策。

      使用基于擴(kuò)增的技術(shù)(qPCR,WGS)的血清分型也提供了區(qū)分特定病原體的亞種的能力。例如,可以使用分子方法區(qū)分超過2500種沙門氏菌亞型,提供比傳統(tǒng)技術(shù)更多的信息。

      Promega公司麥克斯韋是怎樣® RSC病原套件用于凈化細(xì)菌的DNA?這與其他技術(shù)有何不同?

      Maxwell RSC PureFood病原體試劑盒與我們的Maxwell RSC儀器配合使用。這些自動化核酸提取系統(tǒng)使用纖維素磁性顆粒結(jié)合粗制樣品裂解物中的DNA,然后通過一系列洗滌步驟,在洗脫純化的DNA以備下游擴(kuò)增之前,去除任何不需要的抑制劑或材料。

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      Maxwell RSC儀器是基于盒式磁帶的系統(tǒng)。純化所需的所有試劑均以易于使用的盒式磁帶提供??蛻糁恍鑼悠诽砑拥侥兄?,將其放入儀器中,然后運(yùn)行協(xié)議。系統(tǒng)自動執(zhí)行提取,這是與其他技術(shù)的主要區(qū)別。通過去除與旋轉(zhuǎn)柱和其他方法相關(guān)的手動清洗步驟和移液,自動化消除了由于人為錯誤導(dǎo)致的大部分可變性。

      Maxwell RSC PureFood病原體提取方案補(bǔ)充了基于擴(kuò)增的測試,例如qPCR或NGS,它們需要高質(zhì)量的純化DNA。

      Maxwell RSC Purefood Pathogen Kit為研究人員帶來了哪些優(yōu)勢?這種病原體試劑盒如何工作?

      該技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)之一是它允許研究人員在一個步驟中溶解革蘭氏陰性和革蘭氏陽性細(xì)菌。許多其他試劑盒利用酶來消化細(xì)胞壁并幫助打破革蘭氏陽性細(xì)菌。Maxwell RSC Purefood病原體試劑盒中使用的裂解緩沖液化學(xué)溶解這些鍵,使用一步從兩種細(xì)胞類型中釋放DNA。

      實(shí)驗(yàn)室自動化的使用消除了可變性,消除了與手動技術(shù)相關(guān)的不一致性。在提取和重復(fù)中確保一致性。

      最重要的是,通過自動化DNA純化和確保運(yùn)行之間的一致性,Maxwell系統(tǒng)可以讓科學(xué)家們做其他事情,例如準(zhǔn)備樣品或進(jìn)行下游分析,從而提高工作流程的效率。

      Maxwell Purefood病原體試劑盒比其他病原體試劑盒有哪些優(yōu)勢?

      使用差異培養(yǎng)基,進(jìn)行“富集步驟”,其中將可疑食物材料放置在Stomacher內(nèi)以允許存在的任何細(xì)菌生長。然后將樣品置于培養(yǎng)箱中的差異培養(yǎng)基上。此過程需要兩天時間才能完成。

      使用Maxwell系統(tǒng),仍然進(jìn)行過夜孵育富集步驟,但隨后的DNA提取是自動化的,并且可以在8小時輪班中完成多次運(yùn)行。Maxwell RSC儀器可以處理16個樣品,Maxwell RSC 48可以在大約一個小時內(nèi)處理48個樣品。

      下游qPCR分析可能需要半小時到45分鐘。這種自動化允許研究人員在兩到三個小時內(nèi)處理16到48個樣本,包括下游qPCR,而不是手動方法所需的兩天。

      實(shí)驗(yàn)室采用更快速的檢測方法,以更快的時間框架提供可操作的信息,這一點(diǎn)至關(guān)重要。如果擔(dān)心被污染的原材料或食品會被生產(chǎn)出來,結(jié)果可能會迅速返回制造商或?qū)嶒?yàn)室,以便能夠以最小的延遲做出決定。

      可以麥克斯韋® RSC Purefood病原體的試劑盒可以用任何其他產(chǎn)品用于自動化病原體提取和識別的過程?

      我們還提供一個名為MaxPrep的系統(tǒng),該系統(tǒng)可與Maxwell RSC系統(tǒng)一起用于自動化樣品制備,標(biāo)準(zhǔn)化和qPCR設(shè)置。MaxPrep是一個液體處理程序,具有允許研究人員進(jìn)行qPCR設(shè)置的特定協(xié)議。

      MaxPrep配有預(yù)設(shè)協(xié)議,因此用戶不需要編程不同的步驟。在DNA提取的上游側(cè),MaxPrep可以進(jìn)行樣品制備和設(shè)置。Maxwell RSC或RSC 48的甲板托盤放置在MaxPrep內(nèi)部,允許整合提取前和提取后的步驟,包括將洗脫緩沖液和樣品分配到RSC柱中。

      在提取之前和之后使用MaxPrep消除了手動處理的許多難點(diǎn),并且旨在自動化整個工作流程。

      已經(jīng)提取的任何DNA洗脫液都可以在qPCR或終點(diǎn)PCR的下游使用。如果需要,研究人員還可以使用qPCR或吸光度檢測或定量分析物。

      除了專業(yè)知識,提取方案和儀器,Promega還提供qPCR所需的許多緩沖液和酶。

      Promega在使用該病原體試劑盒和儀器時能提供哪些保證?

      我們所有的試劑都經(jīng)過嚴(yán)格的QA標(biāo)準(zhǔn)測試。所有產(chǎn)品都附有分析證書,其中包含所有質(zhì)量測試的詳細(xì)信息。

      作為一名產(chǎn)品經(jīng)理,我生活在反饋中,無論好壞,不僅要改進(jìn)和發(fā)展我們現(xiàn)有的產(chǎn)品,還要填補(bǔ)我們目前沒有提供的產(chǎn)品的空白。

      對于病原體試劑盒,我們早期與行業(yè)中的主要意見領(lǐng)袖密切合作,與他們一起了解他們所面臨的挑戰(zhàn)。他們給了我們一些非常直接的反饋,我們能夠在開發(fā)過程中將其納入我們的產(chǎn)品需求中。最終產(chǎn)品是與業(yè)界合作的高潮。

      您能簡單介紹一下Promega,您的工作以及您所服務(wù)的行業(yè)嗎?

      Promega產(chǎn)品被生命科學(xué)家使用,他們正在詢問有關(guān)生物過程的基本問題,以及應(yīng)用科學(xué)知識診斷和治療疾病,檢測工業(yè)和食品制造過程中的微生物污染,發(fā)現(xiàn)新療法,以及使用遺傳學(xué)和DNA的科學(xué)家測試人體識別。

      Promega最初于1978年在美國威斯康星州麥迪遜市成立,在16個國家設(shè)有分支機(jī)構(gòu),在全球100多個國家設(shè)有分銷商。

      鄭重聲明:本文版權(quán)歸原作者所有,轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的,如有侵權(quán)行為,請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除,多謝。

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