流行性痢疾的基因組研究揭示了歐洲如何在全球范圍內(nèi)出口禍害

關(guān)于引起流行性痢疾的細(xì)菌的最大遺傳研究表明，志賀氏痢疾桿菌病原體在非洲和亞洲仍然是一個(gè)真正的禍害，可能起源于歐洲。這項(xiàng)研究發(fā)表在“ 自然微生物學(xué) ”雜志上，也描繪了病原體對(duì)抗生素耐藥性的發(fā)展。

來自巴黎巴斯德研究所Wellcome Trust Sanger研究所的科學(xué)家和國(guó)際合作者發(fā)現(xiàn)了歷史上發(fā)生的各種爆發(fā)之間迄今未知的聯(lián)系。在整個(gè)18世紀(jì)和19世紀(jì)，人類遭受最嚴(yán)重的禍害之一，痢疾通過移民運(yùn)動(dòng)和軍事行動(dòng)從一個(gè)大陸傳播到另一個(gè)大陸。

細(xì)菌志賀氏痢疾桿菌 1型引起危及生命的血性腹瀉，并導(dǎo)致數(shù)千人死亡，特別是在發(fā)展中國(guó)家的兒童中。中美洲最后一次大流行在1969年至1972年期間造成2萬人死亡。盡管全球痢疾桿菌菌株被隔離，但每種痢疾流行病的起源及其之間的聯(lián)系仍不清楚。

為了詳細(xì)了解這種疾病，由Wellcome Trust Sanger研究所的Nicholas Thomson教授和巴斯德研究所的資深作者François-Xavier Weill博士領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)利用高通量技術(shù)進(jìn)行細(xì)菌基因組測(cè)序的大型基因組研究。和生物信息學(xué)。他們分析了1915年(參加第一次世界大戰(zhàn)加利波利運(yùn)動(dòng)的士兵)和2011年分離出的330多株痢疾志賀氏菌。這些菌株已被66個(gè)國(guó)家的35個(gè)國(guó)際研究所收集。

研究小組發(fā)現(xiàn)，1型菌株至少在18世紀(jì)就存在，并在全球范圍內(nèi)傳播。與普遍看法相反，該研究表明，目前非洲和亞洲流行的痢疾志賀氏菌病原體來自歐洲。

桑格研究所細(xì)菌基因組學(xué)和進(jìn)化組的負(fù)責(zé)人Nicholas Thomson教授說：“分析在很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)收集的所有這些志賀氏痢疾桿菌菌株的全基因組，以及來自不同國(guó)家的這些菌株，為我們提供了前所未有的洞察力。這種病原體的歷史傳播。這是必要的，因?yàn)殛P(guān)于這種臭名昭著的重要細(xì)菌病原體仍有許多未解答的問題。它是通過將高分辨率基因組研究數(shù)據(jù)與記錄大量來自每個(gè)樣本的來源的詳細(xì)信息相結(jié)合而實(shí)現(xiàn)的。專門團(tuán)體。“

通過鑒定不同的遺傳譜系，科學(xué)家能夠追蹤全球細(xì)菌的路徑，表明歐洲殖民主義和遷移有助于傳播病原體。

歐洲痢疾桿菌在1889年至1903年間傳播到美洲，非洲和亞洲，得益于歐洲移民到美國(guó)以及非洲和亞洲領(lǐng)土的殖民化。在第一次和第二次世界大戰(zhàn)期間，這種細(xì)菌再次出現(xiàn)在歐洲，然后在歐洲消失。然而，它繼續(xù)在亞洲，非洲和中美洲蔓延，暴力爆發(fā)，隨后幾次流行病從印度次大陸蔓延到非洲和東南亞。

由于第一批細(xì)菌在使用抗生素之前已被很好地分離出來，因此對(duì)該系列的研究表明，在20世紀(jì)60年代中期，亞洲和美國(guó)首次出現(xiàn)抗生素耐藥性。然后，這種細(xì)菌獲得了針對(duì)大多數(shù)抗生素的抗性基因 - 自20世紀(jì)90年代以來，不到1%的細(xì)菌菌株仍然對(duì)抗生素敏感?？茖W(xué)家認(rèn)為這是不可避免的，并引起人們擔(dān)心痢疾細(xì)菌會(huì)對(duì)最后的抗生素類產(chǎn)生抗藥性。

巴斯德研究所腸道細(xì)菌病原體研究室主任François-Xavier Weill博士說：“這種細(xì)菌仍處于流通狀態(tài)，如果條件證明有利，可能會(huì)對(duì)未來的流行病負(fù)責(zé) - 例如大量無法進(jìn)入的人群該研究強(qiáng)調(diào)了對(duì)有效疫苗的需求，鑒于抗生素的療效降低，這對(duì)于今后控制這種疾病至關(guān)重要。

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