NIH完成了33種癌癥類型的深入基因組分析
馬薩諸塞州貝塞斯達, 2018年4月5日 - 由美國國立衛(wèi)生研究院資助的研究人員完成了一項詳細的基因組分析,稱為PanCancer Atlas,來自10,000多種腫瘤的分子和臨床信息數(shù)據(jù)集,代表33種類型癌癥。
“這個項目是十多年開創(chuàng)性工作的結晶,”美國國立衛(wèi)生研究院院長Francis S. Collins博士說。“這項分析為癌癥研究人員提供了前所未有的對腫瘤在人類中產(chǎn)生的方式,地點和原因,以及更好的臨床試驗和未來治療方法的理解。”
Pan-Cancer Atlas 在一系列Cell期刊上發(fā)表了27篇論文集,總結了癌癥基因組圖譜(TCGA)所完成的工作 - 這是一項由國家人類基因組研究所發(fā)起和支持的多機構合作( NHGRI)和國家癌癥研究所(NCI),都是NIH的一部分。該計劃總資金超過3億美元,涉及北美20多個機構的150多名研究人員。
“TCGA是其規(guī)模第一個在分子水平上表征癌癥的癌癥類型的項目,”NHGRI基因組科學部主任,TCGR NHGRI團隊負責人Carolyn Hutter博士說。“在10年前的項目初期,甚至不可能在這樣的規(guī)模上進行所提出的特征和分析類型。這是一個非常雄心勃勃的項目。”
“PanCancer Atlas的努力補充了 TCGA在過去十年中發(fā)表的30多篇腫瘤特異性論文,并擴展了2013年發(fā)表的早期泛癌工作,”Jean Claude Zenklusen博士說。 NCI的TCGA計劃辦公室。
該項目不僅關注癌癥基因組測序,還關注不同類型的數(shù)據(jù)分析,例如研究基因和蛋白質表達譜,并將它們與臨床和成像數(shù)據(jù)相關聯(lián)。
PanCancer地圖集分為三個主要類別,每個類別都以概要文件為基礎,概述了該主題的核心發(fā)現(xiàn)。主題包括起源細胞,致癌過程和致癌途徑。多篇配套論文報告了對這些類別中各個主題的深入探索。
在第一份總結論文中,作者總結了一組分析的結果,這些分析使用了一種稱為分子聚類的技術,該技術通過諸如表達的基因,腫瘤細胞中染色體數(shù)目的異常和DNA修飾等參數(shù)對腫瘤進行分組。該論文的研究結果表明腫瘤類型通過其可能的起源細胞聚集,這一結果增加了我們對腫瘤組織起源如何影響癌癥特征的理解,并可能導致針對各種癌癥類型的更具體的治療方法。
第二份摘要文件概述了TCGA關于導致癌癥發(fā)展和進展的過程的研究結果。具體而言,作者指出,研究結果確定了三個關鍵的致癌過程:突變,種系(遺傳)和軀體(獲得); 腫瘤的基礎基因組和表觀基因組對基因和蛋白質表達的影響; 以及腫瘤和免疫細胞的相互作用。這些發(fā)現(xiàn)將有助于優(yōu)先開發(fā)針對多種癌癥的新療法和免疫療法。
最后的總結論文詳細介紹了TCGA對控制細胞周期進程,細胞死亡和細胞生長的信號通路中基因組改變的研究,揭示了這些過程在一系列癌癥中的相似性和差異性。他們的研究結果揭示了癌癥潛在脆弱性的新模式,這將有助于聯(lián)合療法和個性化醫(yī)療的發(fā)展。
包含Pan-Cancer Atlas的整個論文集可通過cell.com上的門戶網(wǎng)站獲取。此外,隨著長達十年的TCGA工作的結束,將于2018年9月27日至29日在華盛頓特區(qū)舉行為期三天的TCGA Legacy:Multi-Omic Studies in Cancer,討論大型未來 - 大規(guī)模癌癥研究,會議重點是泛癌癥圖譜。會議將介紹癌癥基因組結構的最新進展,并展示最近在治療靶向方面取得的進展。
關于國家人類基因組研究所(NHGRI): NHGRI在美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)領導基因組學研究,為所有研究機構和中心提供技術專業(yè)知識和指導。我們與同事分享我們開創(chuàng)性的科學和愿景,以加速改善生活的突破。通過與科學和醫(yī)學界的合作,我們促進了新基因組技術的發(fā)展,并支持NIH特定疾病的強大研究和治療。有關NHGRI及其計劃的更多信息,請訪問genome.gov。
關于國家癌癥研究所(NCI): NCI領導國家癌癥計劃和NIH通過研究預防和癌癥生物學,開發(fā)新的干預措施,大幅降低癌癥患病率和改善癌癥患者及其家人的生活的努力,以及新研究人員的培訓和指導。有關癌癥的更多信息,請訪問NCI網(wǎng)站 cancer.gov 或致電NCI的聯(lián)絡中心(以前稱為癌癥信息服務),電話號碼是1-800-4-CANCER(1-800-422-6237)。
關于美國國立衛(wèi)生研究院(NIH):NIH是美國的醫(yī)學研究機構,包括27個研究所和中心,是美國衛(wèi)生和人類服務部的一個組成部分。NIH是主要的聯(lián)邦機構,負責開展和支持基礎,臨床和轉化醫(yī)學研究,并正在研究常見和罕見疾病的原因,治療和治療方法。有關NIH及其計劃的更多信息,請訪問nih.gov。
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