科學(xué)家解碼中國甘草的基因組
在“植物雜志”上發(fā)表的一項研究中,由日本RIKEN可持續(xù)資源科學(xué)中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一組科學(xué)家已經(jīng)解碼了甘草(Glycyrrhiza uralensis)或中國甘草的基因組,甘草是一種在中醫(yī)中使用的重要植物。天然的甜味劑。
中國甘草與甘草糖用植物甘草(Glycyrrhiza glabra)密切相關(guān),是中藥的重要組成部分。負責(zé)該團隊的CSRS的Kazuki Saito表示,“它在日本傳統(tǒng)漢方醫(yī)學(xué)中使用的200種主要配方中約占70%。考慮到90%的日本醫(yī)生在他們的實踐中開出漢方藥,這很容易看看這種植物的重要性。“
該團隊選擇檢查中國甘草的基因組而不是其他相關(guān)物種,部分原因是因為已知含有最高濃度的甘草甜素,這是一種與植物的醫(yī)學(xué)特性相關(guān)的化合物,包括抗炎,抗癌,抗過敏和抗病毒活動。
為了進行篩選,他們選擇了保存在京都藥用植物保護的武田花園的G. uralensis菌株。使用長讀和短讀序列的組合,并通過比較基因組與其他豆科物種的已發(fā)表序列,他們預(yù)測該植物的基因組編碼僅超過34,000種蛋白質(zhì),這一數(shù)字略高于人類基因組中的20,000 。他們特別關(guān)注兩個遺傳區(qū)域 - 一種編碼皂苷,它們是重要的植物化合物,包括甘草甜素,另一種產(chǎn)生異黃酮,它們也被稱為藥用成分。
通過研究,該小組證明甘草與其他相關(guān)植物如barrelclover(接近苜蓿的種類)和鷹嘴豆之間存在密切的基因保護,表明豆科植物使用少量基因來創(chuàng)造“支架”用于生產(chǎn)多種多樣的化合物。
該論文的第一作者Keiichi Mochida說:“中國甘草是一種重要且耗費大量的藥用植物,我們希望我們的工作能夠進行分子育種,以創(chuàng)造在日本可持續(xù)發(fā)展的菌株,以及它產(chǎn)生大量有用的化合物,如甘草甜素。“
據(jù)Saito說,“我們非常希望我們的基因組序列草圖能夠通過分子育種來促進有用基因的鑒定,分離和編輯,從而改善甘草的農(nóng)藝和藥用特性。對于植物的巨大多樣性仍有很多需要了解新陳代謝,這項研究將有助于在這方面取得進一步進展。“
該小組計劃進一步研究G. uralensis基因組與其他甘草物種之間的差異,以進一步加深他們對有用化合物生產(chǎn)的理解。這項工作由RIKEN CSRS與千葉大學(xué),高知大學(xué)和大阪大學(xué)合作開展。
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