科學(xué)家已經(jīng)開發(fā)出一種計算方法來檢測DNA中的化學(xué)變化，突出細胞多樣性，并可能更好地了解癌癥。在歐洲研究中，發(fā)表在核酸研究中并涉及紐卡斯爾大學(xué)，專家們建立了一種生物信息學(xué)方法，可用于造血，即干細胞血液形成的過程。關(guān)于如何在我們體內(nèi)形成不同細胞的信息在我們的基因組中編碼，該基因組由四個DNA字母組成。

每種細胞類型的特征在于其獨特的表觀基因，一個化妝即離開基因組的“打開”或“關(guān)閉”不同部分許多不同的蛋白質(zhì)組成的基因組的。使用不同的化妝品，一個人的相同基因組可編碼必要的信息，以發(fā)展所有不同的組織和器官。開發(fā)的新方法允許自動分析多個表觀基因組，以確定必要的化妝變化形成健康和患病細胞類型的基因組位置。

疾病生物標志物

紐卡斯爾大學(xué)細胞醫(yī)學(xué)研究所研究員Daniel Rico博士說：“我們有技術(shù)來揭示不同的表觀基因組成，這產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)。“我們可以認真談?wù)摫碛^基因組學(xué)研究中的”大數(shù)據(jù)“。然而，主要的瓶頸是將所有這些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為有用的信息，以深入了解生物機制。“我們開發(fā)的新方法將使研究人員能夠識別基因組中的關(guān)鍵區(qū)域，這些區(qū)域根據(jù)細胞類型顯示差異化妝。“由于許多疾病與疾病特異性表觀基因組構(gòu)成有關(guān)，因此該方法對于鑒定化妝品偏離健康狀態(tài)的基因組中的關(guān)鍵區(qū)域特別有用。“這將有助于開發(fā)新的疾病生物標志物，并有望為開發(fā)針對表觀基因組的療法開辟新的道路。”

該方法允許整合各種表觀基因組數(shù)據(jù)集以對不同樣品進行分類并自動識別其中變化影響細胞類型定義的基因組區(qū)域?；蚪M化妝

人類基因組是一個沉悶的字母序列，但由于表觀基因組的幫助它變得活著。

基因組就像一本書，其中字母相互跟隨，沒有空格，句號或逗號。讀這本書是非常困難的，完全不可能理解它。

然而，通過簡單地添加標點符號，我們可以閱讀并理解那些顯然是沉悶的字母序列的含義。

這是表觀基因組完成的一項重大任務(wù)，它由DNA上的化學(xué)變化組成，使我們和細胞能夠理解如何閱讀和解釋基因組。

因此，研究表觀基因組對于了解發(fā)育如何能夠產(chǎn)生形成組織和器官的多種細胞類型非常重要，所有這些都是從單個細胞和單個基因組開始的。

表觀基因組還經(jīng)常參與解釋健康細胞在惡性轉(zhuǎn)化后如何產(chǎn)生腫瘤。但是，盡管迄今為止收集了大量數(shù)據(jù)，但將基因組區(qū)域的化學(xué)變化和變化類型定位仍然是一個挑戰(zhàn)。

這些化學(xué)變化在發(fā)育期間和整個生命過程中產(chǎn)生，作為外部因素的影響，例如生活方式，它們可以引發(fā)癌癥等疾病。識別表觀遺傳學(xué)生物標志物是實現(xiàn)新的診斷和治療選擇的基礎(chǔ)。

考慮到基因表達水平作為生物標志物，使用它們的開/關(guān)狀態(tài)，已經(jīng)廣泛使用分子分類。

這種方法可以讓研究人員識別那些參與調(diào)節(jié)開/關(guān)基因狀態(tài)的區(qū)域，如生物開關(guān)。這些區(qū)域可用作表觀遺傳生物標志物，補充實際的分子分類。

重要的發(fā)展

該研究的共同第一作者，來自西班牙國家癌癥研究中心的Enrique Carrillo-de-Santa-Pau說：“這種方法的發(fā)展非常重要。

“到目前為止，細胞類型之間的差異主要表現(xiàn)在開啟或關(guān)閉的基因水平，這是表觀基因組調(diào)控的最終產(chǎn)物，但我們不知道這些基因的開關(guān)在哪里(編碼于的表觀基因組)。

“這種獲得的知識對于在細胞失去對癌癥等疾病的控制的情況下基于正確開關(guān)的新療法是至關(guān)重要的。

“了解這一級別的監(jiān)管將使我們在個性化醫(yī)療議程中更進一步。”

希望這種方法能夠讓科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)新的表觀遺傳生物標志物，這些生物標志物可用于個性化醫(yī)學(xué)的診斷和治療。