生命科學(xué)如何處理它如何處理基因組信息的山脈
基因測(cè)序技術(shù)在過(guò)去的幾十年中取得了突飛猛進(jìn)的發(fā)展。但是,隨著基因組學(xué)家和參與研究項(xiàng)目的其他人產(chǎn)生大量的DNA,RNA或蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù),他們很清楚,存儲(chǔ)和分析所有這些信息正在迅速成為一個(gè)棘手的問(wèn)題。
在最近的一篇文章中 紐約時(shí)報(bào)突出的困難,列舉多家領(lǐng)先的研究播出他們的挫折與測(cè)序和數(shù)據(jù)處理技術(shù)之間創(chuàng)新的步伐不一致。“數(shù)據(jù)處理現(xiàn)在已成為瓶頸,”加州大學(xué)圣克魯茲分校生物分子科學(xué)與工程中心主任大衛(wèi)·豪斯勒告訴“ 紐約時(shí)報(bào)”。“分析基因組比分析基因組需要花費(fèi)更多。”
實(shí)際上,盡管預(yù)計(jì)整個(gè)人類基因組測(cè)序的價(jià)格將在未來(lái)幾年內(nèi)降至預(yù)期的1000美元大關(guān),但這種成本與存儲(chǔ)和分析基因組數(shù)據(jù)的費(fèi)用相比相形見(jiàn)絀。
和海量數(shù)據(jù)(其中科學(xué)家覆蓋在其10月份發(fā)行)也可能會(huì)導(dǎo)致設(shè)計(jì)存儲(chǔ)信息庫(kù)聯(lián)邦的模板。據(jù)“ 泰晤士報(bào)”報(bào)道,僅在過(guò)去的一年中,存儲(chǔ)在一個(gè)這樣的數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)量增加了兩倍以上,在300萬(wàn)億個(gè)含氮堿基的接縫處膨脹,占據(jù)了近700萬(wàn)億字節(jié)的計(jì)算機(jī)內(nèi)存。
太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的生物學(xué)家Steven Wiley告訴“ 紐約時(shí)報(bào)”說(shuō):“我們擁有這些巨大的數(shù)據(jù),無(wú)法連接它們。” “我坐在我們過(guò)去一年半一直試圖分析的一堆數(shù)據(jù)前面。”
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