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      微生物暗物質(zhì)主導(dǎo)著地球的環(huán)境

      根據(jù)mSystems發(fā)表的一項(xiàng)新研究,未培養(yǎng)的微生物 - 那些其特征從未被描述過,因?yàn)樗鼈兩形丛趯?shí)驗(yàn)室培養(yǎng)中生長 - 可能在地球上幾乎所有的環(huán)境中都占主導(dǎo)地位,除了人體。

      微生物暗物質(zhì)主導(dǎo)著地球的環(huán)境

      該研究由田納西大學(xué)諾克斯維爾微生物學(xué)系副教授Karen Lloyd領(lǐng)導(dǎo)。勞埃德的研究是第一次估計(jì)未培養(yǎng)的微生物種群。

      科學(xué)家們早就意識到這種未培養(yǎng)的微生物,科學(xué)家們也將其稱為微生物暗物質(zhì)。然而,一個(gè)接一個(gè)地計(jì)算它們將是一項(xiàng)不可能完成的任務(wù),到目前為止,研究人員甚至無法估計(jì)它們中有多少。

      勞埃德和她的團(tuán)隊(duì)現(xiàn)在有了一個(gè)答案:他們相信,地球上多達(dá)四分之一的微生物可能來自大約30個(gè)門 - 一個(gè)從未培養(yǎng)過的王國和類別的微生物之間的分類學(xué)分類。

      Lloyd用一個(gè)例子說明了這一點(diǎn):“所有脊椎動(dòng)物,每一只有脊柱的動(dòng)物都被包含在一個(gè)門中。所以這意味著我們可能有30種不同類型的微生物,每種微生物都與任何已知的微生物不同。長頸鹿來自海星。“

      為了估計(jì)有多少未培養(yǎng)的微生物稱這個(gè)星球?yàn)榧?,Lloyd和她的團(tuán)隊(duì)收集了全世界研究人員在公共數(shù)據(jù)庫中保存的每個(gè)DNA序列,共計(jì)150萬,并將它們與26,000個(gè)已經(jīng)培養(yǎng)的微生物和細(xì)菌DNA序列進(jìn)行比較。

      “我們很快就遇到了嚴(yán)重的計(jì)算限制,但幸運(yùn)的是,我們與橡樹嶺國家實(shí)驗(yàn)室的計(jì)算科學(xué)聯(lián)合研究所進(jìn)行了很好的合作,”勞埃德說。“他們能夠提供完成工作所需的計(jì)算能力。”

      對未培養(yǎng)的微生物的研究和表征可以是特定領(lǐng)域中特別有價(jià)值的工具 - 例如在醫(yī)學(xué)中,科學(xué)家已經(jīng)描述了培養(yǎng)抗性病原體的病例。

      “未培養(yǎng)的微生物與培養(yǎng)的微生物有很大的不同,它們可能會做出不同尋常的事情,比如以極低的能量生存或以非常緩慢的速度生長,這種方式對我們來說甚至難以想象。這些微生物也可能不會他們在文化中獨(dú)立生長,因?yàn)槿绻麄儚谋舜嘶蚱涮囟ōh(huán)境中錯(cuò)綜復(fù)雜的關(guān)系中消失,他們就會死亡。因?yàn)檫@些微生物提供了許多生態(tài)系統(tǒng)服務(wù) - 例如幫助作物生長和應(yīng)對氣候變化 - 解決了他們所面臨的相當(dāng)大的難題向我們展示了現(xiàn)代微生物學(xué)面臨的重大挑戰(zhàn),“勞埃德說。

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