生物學(xué)家報告了計算細(xì)胞 基因的終生能量需求的方法
在最近發(fā)表的一篇論文中,印第安納大學(xué)的生物學(xué)家已經(jīng)計算了多種類型細(xì)胞的終生能量需求,以及在這些細(xì)胞中復(fù)制和表達(dá)基因所需的能量。“ 美國國家科學(xué)院院刊 ”報道的“基因的生物能量成本” 首次描述了構(gòu)建和維持細(xì)胞需要多少總能量,以及它如何隨細(xì)胞大小而變化。
“這項研究試圖系統(tǒng)地在多種物種中全面地繪制細(xì)胞的終生能量需求,以及維持和表達(dá)基因組的總成本,”IU生物學(xué)家邁克爾林奇說,他領(lǐng)導(dǎo)了這項研究。“它還以一種堅實的方式否定了復(fù)雜細(xì)胞在沒有能量產(chǎn)生線粒體的情況下永遠(yuǎn)不會進(jìn)化的共同論點(diǎn)。”
林奇是IU布盧明頓藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院生物系的杰出教授。生物學(xué)博士后研究員Georgi K. Marinov是該論文的共同作者。該研究是Lynch實驗室為計算細(xì)胞各部分(包括細(xì)胞膜和內(nèi)部細(xì)胞器)的精確能量成本而進(jìn)行的更大努力的一部分。
文章中報道的第一步描述了單個基因的總能量消耗,如DNA,RNA和蛋白質(zhì)水平所致。
為了進(jìn)行這項研究,Lynch和Marinov回顧了可追溯到20世紀(jì)60年代的論文,每篇論文都關(guān)注不同的生物,并應(yīng)用當(dāng)前關(guān)于代謝途徑和單細(xì)胞屬性的信息來確定每個細(xì)胞的終生能量需求。他們指出了“維持細(xì)胞所需的能量”和“構(gòu)建下一代后代細(xì)胞所需部分所需的能量”,林奇說。目標(biāo)是“找到分母”,或者將每個其他結(jié)構(gòu)的需求分成的總能量。
研究中使用的能量單位是ATP,或腺苷三磷酸腺苷,這是一種簡單的分子,通過磷酸鹽鍵斷裂,成為細(xì)胞中細(xì)胞能量的主要載體。就能量而言,當(dāng)這些鍵之一被破壞時,單個ATP分子產(chǎn)生大約十分之一的焦耳。
研究中最簡單的細(xì)胞,細(xì)菌,在其一生中需要大約1億個ATP能量分子。研究中最復(fù)雜的細(xì)胞,即真核細(xì)胞,在整個生命周期中需要超過1000倍。
在真核生物中,ATP主要由線粒體產(chǎn)生,線粒體是負(fù)責(zé)復(fù)雜真核細(xì)胞中大部分能量利用的細(xì)胞結(jié)構(gòu)。
因為它們具有獨(dú)立于其宿主細(xì)胞的基因組,所以已知線粒體起源于大約20億年前被吸收到早期單細(xì)胞生物中的古老細(xì)菌。
共生的術(shù)語用于描述在單細(xì)胞生物體吸收線粒體的細(xì)菌祖先后,沒有細(xì)胞核或細(xì)胞器 - 原核生物的細(xì)胞產(chǎn)生具有細(xì)胞核和細(xì)胞器 - 真核生物的更復(fù)雜細(xì)胞的概念。它被認(rèn)為是進(jìn)化史上最重要的事件之一。
然而,令人驚訝的是,IU科學(xué)家發(fā)現(xiàn),隨著細(xì)胞變得越來越復(fù)雜,能量消耗隨細(xì)胞體積呈線性增長,而不是呈指數(shù)或逐步增長。因此,盡管真核細(xì)胞需要更多能量用于細(xì)胞繁殖,但與原核細(xì)胞相比,它們相對于細(xì)胞體積不會以更高的速率增加其能量需求。
“通過線粒體產(chǎn)生能量的增強(qiáng)能力通常被視為真核細(xì)胞特征進(jìn)化的先決條件,例如基因數(shù)量增加,蛋白質(zhì)長度,蛋白質(zhì)折疊,蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用和調(diào)節(jié)元件,”Lynch說。“但我們的觀察結(jié)果表明,與線粒體相關(guān)的能量增加不是基因組復(fù)雜性的先決條件。”
林奇說,研究人員項目的最終目標(biāo)類似于想知道建房成本的房主。
“如果你的預(yù)算有限,那么在你知道所有材料的成本之前就不能開始施工,”林奇說。同樣,進(jìn)化不是免費(fèi)的,構(gòu)建細(xì)胞的每個部分都需要可以在其他地方使用的成本。
了解這些成本與效益之間的關(guān)系將有助于闡明自然選擇等力量如何影響地球上發(fā)現(xiàn)的巨大細(xì)胞多樣性。
例如,如果構(gòu)建結(jié)構(gòu)的成本與獲得的效益大致相同,則從長遠(yuǎn)來看,沒有適應(yīng)性的凈收益或損失。
“這項工作與大量理論聯(lián)系在一起,概述了越來越合理的情景,復(fù)雜的特征可能通過自然選擇以外的機(jī)制出現(xiàn),”林奇說。“我們再也不能簡單地假設(shè)有機(jī)體的所有特征都來自于自然選擇的促進(jìn)。”
Read more at: https://phys.org/news/2015-11-biologists-method-lifetime-energy-requirements.html#jCp
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