遺傳搜索揭示了全球棉花害蟲(chóng)的抗性關(guān)鍵
在農(nóng)民和蟲(chóng)子之間無(wú)休止的戰(zhàn)爭(zhēng)的最近一次戰(zhàn)斗中,這些蟲(chóng)子正在適應(yīng)通過(guò)基因工程殺死它們的作物。發(fā)表在一項(xiàng)新的研究的美國(guó)國(guó)家科學(xué)院論文集標(biāo)識(shí)賦予顯性遺傳突變抗性的棉鈴蟲(chóng),是世界上最具破壞性的作物害蟲(chóng)之一的毛毛蟲(chóng)工程棉花。該研究對(duì)基因組學(xué)和基因編輯的前沿使用標(biāo)志著全球努力促進(jìn)更可持續(xù)的害蟲(chóng)控制的新時(shí)代。
棉花,玉米和大豆已經(jīng)過(guò)基因工程改造,可以從廣泛存在的土壤細(xì)菌蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis)或Bt中生產(chǎn)殺蟲(chóng)蛋白。這些環(huán)境友好型Bt蛋白質(zhì)對(duì)人類和野生動(dòng)物(包括蜜蜂)無(wú)毒,已被有機(jī)種植者用于噴霧劑超過(guò)50年,以及全球數(shù)百萬(wàn)農(nóng)民種植的工程化Bt作物,自累計(jì)總面積超過(guò)20億英畝以來(lái)1996年。
亞利桑那大學(xué),田納西大學(xué)和中國(guó)南京農(nóng)業(yè)大學(xué)的昆蟲(chóng)學(xué)家合作進(jìn)行了這項(xiàng)由三部分組成的研究。他們的目標(biāo)是確定在棉鈴蟲(chóng)中賦予Bt抗性的突變,精確編輯一個(gè)棉鈴蟲(chóng)基因以證明這種突變導(dǎo)致抗性并發(fā)現(xiàn)抗性如何通過(guò)中國(guó)的棉田傳播。
“這是一個(gè)非凡的偵探故事,”UA昆蟲(chóng)學(xué)系的Regents教授,該研究的共同作者Bruce Tabashnik說(shuō)。“如果沒(méi)有遺傳技術(shù)的最新進(jìn)展,就不可能找到單個(gè)DNA堿基對(duì)的變化,導(dǎo)致棉鈴蟲(chóng)基因組中數(shù)億個(gè)堿基對(duì)的抗性。”
多年來(lái),科學(xué)家們已經(jīng)知道昆蟲(chóng)可以進(jìn)化出對(duì)Bt蛋白的抗性,正如它們對(duì)常規(guī)殺蟲(chóng)劑一樣。然而,在幾乎所有先前研究的病例中,Bt抗性是隱性遺傳的。這意味著昆蟲(chóng)必須有兩個(gè)抗性基因拷貝 - 每個(gè)親本一個(gè) - 使它們能夠在Bt作物上進(jìn)食和存活。
為了抵抗抵抗力,農(nóng)民種植非Bt作物的庇護(hù)所,那里的易感昆蟲(chóng)可以茁壯成長(zhǎng)。這個(gè)想法是罕見(jiàn)的抗性昆蟲(chóng)將與來(lái)自避難所的更豐富的易感昆蟲(chóng)交配,產(chǎn)生僅含有一個(gè)抗性基因拷貝的后代。由于隱性遺傳抗性,這種后代不能在Bt作物上存活。
雖然避難所并沒(méi)有完全阻止抵抗的演變,但它們可以大大延遲 - 特別是當(dāng)?shù)挚故请[性的時(shí)候。
但在中國(guó),報(bào)告稱,對(duì)Bt的主要棉鈴蟲(chóng)抗性正在上升。只有一個(gè)顯性突變的拷貝使棉鈴蟲(chóng)抗性。
由于優(yōu)勢(shì)Bt抗性的遺傳基礎(chǔ)以前是未知的,研究人員不得不仔細(xì)檢查棉鈴蟲(chóng)的整個(gè)基因組以找到罪魁禍?zhǔn)?。通過(guò)比較抗性和易感棉鈴蟲(chóng)的DNA,他們將搜索范圍從17,000個(gè)基因縮小到僅有21個(gè)與抗性相關(guān)的基因區(qū)域。
“但這些基因中只有17種能編碼由毛蟲(chóng)產(chǎn)生的蛋白質(zhì),”塔巴什尼克說(shuō),他解釋說(shuō),只有棉鈴蟲(chóng)毛蟲(chóng)以棉花為食,才能被Bt蛋白殺死。
“比較菌株間17個(gè)基因的序列,只有一個(gè)一致的差異,”Tabashnik說(shuō)。“有一個(gè)位置,所有抗性棉鈴蟲(chóng)都有一個(gè)DNA堿基對(duì),所有易感棉鈴蟲(chóng)都有不同的DNA堿基對(duì)。”
這個(gè)關(guān)鍵的堿基對(duì)位于一個(gè)名為HaTSPAN1的新鑒定基因中,該基因編碼四跨膜蛋白 - 一種含有跨越細(xì)胞膜的四個(gè)區(qū)段的蛋白質(zhì)。雖然HaTSPAN1的正常功能尚不清楚,但許多其他四跨膜蛋白在細(xì)胞間通訊中很重要。盡管先前對(duì)Bt或四跨膜蛋白進(jìn)行了近30,000次研究,但這項(xiàng)新研究首次發(fā)現(xiàn)它們之間存在緊密聯(lián)系。
鑒定突變堿基對(duì),第二個(gè)挑戰(zhàn)是確定這個(gè)單一突變是否導(dǎo)致抗性。為了找到答案,研究小組使用基因編輯工具CRISPR來(lái)精確改變HaTSPAN1基因。當(dāng)基因在抗性棉鈴蟲(chóng)中被破壞時(shí),它們變得對(duì)Bt完全敏感。相反,當(dāng)突變被插入敏感棉鈴蟲(chóng)的DNA中時(shí),它們變得具有抗性,證明單獨(dú)這種單堿基對(duì)變化可以引起抗性。
最后一步是檢驗(yàn)這一突變有助于對(duì)田間Bt棉的抗性的假設(shè)。通過(guò)篩選2006年至2016年間收集的數(shù)千只保存的棉鈴蟲(chóng)蛾的DNA突變,研究人員發(fā)現(xiàn)突變的頻率增加了100倍,從1/1000增加到1/10。
抗性棉鈴蟲(chóng)還不足以明顯減少中國(guó)的棉花產(chǎn)量,但優(yōu)勢(shì)基因的傳播速度比其他抗性基因快。Tabashnik的分析預(yù)測(cè),如果目前的趨勢(shì)持續(xù)下去,中國(guó)北方棉鈴蟲(chóng)的一半將在五年內(nèi)產(chǎn)生這種突變所帶來(lái)的抗性。
塔巴什尼克說(shuō):“如果事情繼續(xù)沿著同樣的軌跡前進(jìn),那么這種突變將給該領(lǐng)域的農(nóng)民帶來(lái)問(wèn)題。”
然而,對(duì)于中國(guó)的農(nóng)民來(lái)說(shuō),改變他們的策略并抵御Bt阻力已經(jīng)足夠早了。該論文提到他們可以從僅產(chǎn)生一種Bt蛋白質(zhì)的棉花轉(zhuǎn)變?yōu)樵诿绹?guó)和澳大利亞種植的棉花類型,這些棉花產(chǎn)生兩種或三種不同的Bt蛋白質(zhì)。Tabashnik希望這項(xiàng)新研究能夠促進(jìn)農(nóng)民的可持續(xù)發(fā)展。
塔巴什尼克說(shuō):“它為他們提供了信息,以便在為時(shí)已晚之前做出建設(shè)性的,主動(dòng)的決定。”
通過(guò)每年對(duì)害蟲(chóng)種群進(jìn)行抽樣,農(nóng)民和研究人員可以了解哪種方法對(duì)阻止抗藥性最有效。
了解棉鈴蟲(chóng)抗性具有全球意義,因?yàn)樗l(fā)生在150多個(gè)國(guó)家,現(xiàn)在有可能侵入美國(guó)。
“這將是有趣的篩選這種突變的棉花來(lái)自澳大利亞,印度和巴西棉鈴蟲(chóng),”一東武,在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)昆蟲(chóng)學(xué)教授誰(shuí)領(lǐng)導(dǎo)的研究在中國(guó)說(shuō)。
當(dāng)然,掃描基因組的技術(shù)不限于一種作物害蟲(chóng)。
“數(shù)據(jù)顯示,基因組掃描不僅有助于監(jiān)測(cè)Bt的抗性進(jìn)化,而且對(duì)于一般的殺蟲(chóng)劑也有幫助。”Fred Gould說(shuō),他沒(méi)有參與這項(xiàng)研究,但是北卡羅來(lái)納州立大學(xué)昆蟲(chóng)學(xué)教授和成員美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院士。
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