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      新加坡的研究人員開發(fā)了一種新的高通量方法,該方法可以確定核糖核酸(RNA)分子如何以無偏見和大規(guī)模的方式聚集在細(xì)胞內(nèi)。這種新開發(fā)的技術(shù)命名為SPLASH,或補(bǔ)骨脂連接和選擇雜交體的測序,用于描述人類和酵母細(xì)胞中的RNA網(wǎng)絡(luò),其動力學(xué)以及結(jié)構(gòu)組織如何影響細(xì)胞中的翻譯和衰變過程。

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      該項目由A * STAR新加坡基因組研究所(GIS)的萬悅和Niranjan Nagarajan共同領(lǐng)導(dǎo),并于2016年5月12日在線發(fā)表于Molecular Cell。

      RNA是在調(diào)節(jié)細(xì)胞中基因表達(dá)中起重要作用的關(guān)鍵分子。雖然科學(xué)界已經(jīng)廣泛研究了過去幾十年中蛋白質(zhì)和染色質(zhì)等微型細(xì)胞機(jī)器如何相互折疊和相互作用,但人們對RNA如何與自身或與其他RNA分子相互作用知之甚少。這種限制促使團(tuán)隊提出SPLASH以促進(jìn)對RNA相互作用的理解。

      該研究的共同主要作者和GIS干細(xì)胞與再生生物學(xué)初級首席研究員Wan博士說:“細(xì)胞是一臺復(fù)雜的機(jī)器;我們需要了解其所有組件的配置,以便能夠設(shè)計和/或RNA形狀和RNA相互作用網(wǎng)絡(luò)是細(xì)胞功能的關(guān)鍵。根據(jù)細(xì)胞需求,這些動態(tài)相互作用網(wǎng)絡(luò)可以進(jìn)行改造。最重要的是,靶向這些網(wǎng)絡(luò)可能是抑制傳染性生物的一種手段。Wan博士于2014年獲得了著名的Branco Weiss獎學(xué)金,并因其抗菌藥物耐藥性而于2015年獲得青年科學(xué)家獎。

      該方法將使研究小組能夠研究傳染性生物的轉(zhuǎn)錄組 - 包括致病細(xì)菌,登革熱和寨卡病毒 - 以了解這些基因組中RNA形態(tài)和網(wǎng)絡(luò)如何通過病原體感染人類細(xì)胞。希望這些理解微生物致病性的努力將有助于新的抗微生物劑,抗病毒劑或針對這些病原體的疫苗。

      “能夠首次全面了解RNA相互作用組并捕捉其動力學(xué),這是令人興奮的。我們現(xiàn)在擁有了解RNA結(jié)構(gòu)組織如何影響疾病和病原體生物學(xué)的工具,最終的目標(biāo)是利用這種理解新藥和這篇論文的共同主要作者,GIS計算與系統(tǒng)生物學(xué)首席研究員Nagarajan博士補(bǔ)充說,“抗菌藥物”。

      地理信息系統(tǒng)執(zhí)行主任Ng Huck Hui教授說:“理解RNA相互作用網(wǎng)絡(luò)和基因調(diào)控是科學(xué)界關(guān)注的一個領(lǐng)域。在SPLASH發(fā)展之前,很少有工具可以讓研究人員深入研究這一研究領(lǐng)域?,F(xiàn)在,我們開始了解不同生物體內(nèi)RNA 相互作用網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)。我希望它能幫助社區(qū)更好地了解RNA在體內(nèi)如何發(fā)揮作用,從而從他們新獲得的見解中獲益。“

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