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      ATCC推出參考質(zhì)量基因組序列的新數(shù)據(jù)庫以協(xié)助生物學(xué)研究
      
			
      
				2019-10-08 10:06:56
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      ATCC推出了新的ATCC Genome Portal，這是一個公開的參考質(zhì)量基因組序列數(shù)據(jù)庫，與經(jīng)過身份驗證的ATCC生物材料相匹配，這將有助于研究人員滿懷信心地解釋和再現(xiàn)其結(jié)果。該門戶網(wǎng)站最初以廣泛使用的細菌菌株的250個基因組序列啟動，實現(xiàn)了ATCC的“增強認證計劃”，該計劃是“ 難以置信的2020年計劃”旨在提高生物研究可重復(fù)性的五項核心承諾中的第一項。
      

      ATCC推出參考質(zhì)量基因組序列的新數(shù)據(jù)庫以協(xié)助生物學(xué)研究
      

      當前公開可用的基因組序列缺乏真實性，質(zhì)量，完整性或可追溯性，這會損害結(jié)果。由于缺乏用于開發(fā)和驗證參考質(zhì)量基因組序列的標準化方法，這一問題更加嚴重。
      

      ATCC通過開發(fā)用于生成參考質(zhì)量基因組的標準化工作流程來解決此問題。從低合格的經(jīng)過驗證的ATCC材料開始，并使用標準化的下一代測序和雜交組裝方法，ATCC通過將高精度的短讀本與超長讀本的支架功能相結(jié)合，產(chǎn)生了完整的參考質(zhì)量基因組。此工作流程的每個步驟均經(jīng)過嚴格的質(zhì)量控制分析，以確保進入下一步的數(shù)據(jù)盡可能達到最高質(zhì)量—只有通過所有質(zhì)量控制標準的數(shù)據(jù)才發(fā)布到ATCC基因組門戶。
      

      為了使科學(xué)家能夠準確地解釋其結(jié)果并與計算機模擬模型進行深入的關(guān)聯(lián)，他們需要獲得經(jīng)過嚴格驗證的參考基因組，這些參考基因組與可靠的生物材料相關(guān)聯(lián)。通過我們的增強身份驗證計劃，我們已經(jīng)確定了現(xiàn)有公開數(shù)據(jù)的主要挑戰(zhàn)，并開發(fā)了一種用于提高參考基因組序列質(zhì)量的解決方案。我們很高興能夠為科學(xué)界提供這種資源。
      

      研究人員可以下載高質(zhì)量的基因組序列，以用于生物信息學(xué)分析，查看帶注釋的數(shù)據(jù)以及使用自己的數(shù)據(jù)搜索基因組。ATCC將在可用的其他基因組不斷更新門戶。
      
			

			
        
      
			
      
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