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      新的工具判斷計算機預(yù)測腫瘤遺傳多樣性的準(zhǔn)確性
      
			
      
				2020-01-14 10:39:41
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      癌癥通常由許多細胞組成，這些細胞在基因上彼此不同。這些基因差異意味著這種癌癥可能對某種治療特別敏感或有抵抗力。因此，識別這些變異可以幫助臨床醫(yī)生決定哪一種治療最可能對特定的病人成功。
      由于檢測遺傳變異的簡單臨床方法容易丟失大量的細胞間變異，因此最近開發(fā)了計算機工具來預(yù)測和表征臨床腫瘤樣本中的遺傳多樣性。但是，目前還沒有通用的基準(zhǔn)測試方法來確定最精確的計算方法。
      這項發(fā)表在《自然生物技術(shù)》雜志上的研究開發(fā)了一種開源軟件，可以用來判斷計算機預(yù)測的準(zhǔn)確性，并建立這一基準(zhǔn)。
      該團隊開發(fā)了一個模擬框架和評分系統(tǒng)，以確定每個算法預(yù)測遺傳多樣性的各種指標(biāo)的準(zhǔn)確性。這些包括:腫瘤樣本中癌細胞的比例;腫瘤樣本中基因不同的癌細胞群的數(shù)量;每組細胞的比例;每組有哪些基因突變;以及群體之間的遺傳關(guān)系。
      我們的新框架提供了一個基礎(chǔ)，隨著時間的推移，它將對抗更多的腫瘤，有望成為一個急需的、公正的、黃金標(biāo)準(zhǔn)的基準(zhǔn)測試工具，用于評估旨在表征腫瘤遺傳多樣性的模型?！?/p>
      馬克西姆·塔拉比奇，聯(lián)合首席作者，克里克癌癥基因組實驗室博士后。
      研究人員在現(xiàn)有的計算機軟件的基礎(chǔ)上生成并分析了本次研究中的580個預(yù)測，為軟件添加了新的功能，從而創(chuàng)造出更真實的腫瘤。這個腫瘤模擬軟件和評分框架是公開的，供其他研究人員直接使用或幫助開發(fā)他們自己的評分框架。
      癌癥基因組學(xué)中的計算機模擬正在幫助我們開發(fā)更精確的工具，因為我們了解這些工具在哪些方面表現(xiàn)良好，哪些方面需要改進。進一步開發(fā)這些工具，使它們更接近現(xiàn)實生活中的腫瘤，最終將幫助臨床醫(yī)生更好地為患者提供個性化藥物?！?/p>			

			
        
      
			
      
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