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      科學(xué)家開發(fā)了一種新方法來(lái)了解DROSHA蛋白切割的位置和位置
      
			
      
				2019-06-26 09:40:45
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			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      我們身體的每個(gè)細(xì)胞都是一個(gè)復(fù)雜機(jī)制的管弦樂隊(duì)的結(jié)果，這些機(jī)制可以控制哪些基因在任何特定時(shí)間都被表達(dá)。部分地，這可能歸功于幾種類型的RNA分子的協(xié)調(diào)，例如microRNA(miRNA)。基礎(chǔ)科學(xué)研究所(IBS)內(nèi)的RNA研究中心的研究人員開發(fā)了一種名為fCLIP-seq的新技術(shù)，該技術(shù)可分析由RNA切割蛋白DROSHA產(chǎn)生的miRNA片段。DROSHA調(diào)節(jié)了幾個(gè)過程，例如神經(jīng)元發(fā)育，骨髓形成和RNA病毒的抑制。因此，預(yù)計(jì)本研究將開辟新途徑，以了解DROSHA在這些重要生物現(xiàn)象中的作用。Molecular Cell提供了對(duì)這些發(fā)現(xiàn)的完整描述。
      

      科學(xué)家開發(fā)了一種新方法來(lái)了解DROSHA蛋白切割的位置和位置
      

      miRNA是基因調(diào)控的一個(gè)重要和古老的組成部分，它調(diào)節(jié)多達(dá)30-60%的哺乳動(dòng)物蛋白編碼基因的表達(dá)，通常使它們沉默。超過2,000種miRNA存在于人體細(xì)胞中，在發(fā)育，細(xì)胞分化，細(xì)胞分裂，細(xì)胞死亡和癌癥發(fā)展中發(fā)揮著各種關(guān)鍵作用。成熟的miRNA是短RNA分子，長(zhǎng)約22個(gè)核苷酸，源自多步驟過程，其開始于稱為初級(jí)miRNA(pri-miRNA)的較長(zhǎng)RNA片段。DROSHA功能是將這些pri-miRNA切割成較短的片段。
      

      該研究是pri-miRNA上DROSHA切割位點(diǎn)的第一次基因組規(guī)模分析。“fCLIP-seq代表甲醛交聯(lián)，免疫沉淀和測(cè)序。通過用甲醛處理細(xì)胞，我們?cè)O(shè)法保持DROSHA與其RNA結(jié)合物之間的結(jié)合，這樣我們就可以研究DROSHA與其結(jié)合的位置和切割位置， “該研究的第一作者KIM Baekgyu解釋說。“這一結(jié)果不僅可以作為miRNA研究的良好數(shù)據(jù)庫(kù)，而且可以加深我們對(duì)miRNA生成的理解。”
      

      該研究小組在pri-miRNA上發(fā)現(xiàn)了數(shù)百個(gè)DROSHA切割位點(diǎn)，包括即使在世界上最大的miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)miRBase中也未發(fā)現(xiàn)的新信息。
      

      有趣的是，IBS生物學(xué)家在DROSHA處理后發(fā)現(xiàn)了額外的miRNA末端修飾，預(yù)計(jì)這對(duì)miRNA生物發(fā)生的調(diào)節(jié)很重要，miRNA生物發(fā)生的失調(diào)通常與疾病有關(guān)，特別是與癌癥有關(guān)。
      

      此外，他們發(fā)現(xiàn)多種替代DROSHA切割模式，從相同的pri-miRNA前體開始產(chǎn)生不同的miRNA產(chǎn)物。僅在極少數(shù)miRNA中報(bào)告，IBS科學(xué)家發(fā)現(xiàn)這實(shí)際上發(fā)生在幾種情況下。
      

      該研究小組還發(fā)現(xiàn)，DROSHA可以切割數(shù)十種非pri-miRNA靶點(diǎn)，這表明DROSHA具有新的可能功能，可以進(jìn)一步探索。
      
			

			
        
      
			
      
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