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      科學(xué)家開發(fā)出新的方法來識別蛋白質(zhì)的重要??未被發(fā)現(xiàn)的功能
      
			
      
				2019-05-09 09:33:49
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      在繁忙的細(xì)胞環(huán)境中，蛋白質(zhì)相互碰到成千上萬。盡管有喧囂，但由于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究數(shù)十年，表面上的特定接觸區(qū)域仍然比預(yù)期的更加神秘，因此每個人都能選擇與合適的合作伙伴進(jìn)行選擇性交互。
      

      科學(xué)家開發(fā)出新的方法來識別蛋白質(zhì)的重要??未被發(fā)現(xiàn)的功能
      

      現(xiàn)在，Salk研究所的科學(xué)家已經(jīng)開發(fā)出一種新方法來發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)上的哪些表面接觸對這些細(xì)胞相互作用至關(guān)重要。這種新方法表明即使對于研究良好的蛋白質(zhì)也可以發(fā)現(xiàn)必要的新功能，并且對治療藥物開發(fā)具有重要意義，這在很大程度上取決于藥物與細(xì)胞靶標(biāo)的物理相互作用。該論文于11月底出現(xiàn)在Genetics的早期在線版本中，并將于1月份的期刊印刷版上發(fā)表。
      

      “本文闡述了這種方法的力量，”Ralph S.和Becky O'Conner主席的資深作者Vicki Lundblad說道。“它不僅可以識別以前未發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)活性，還可以確定蛋白質(zhì)表面上確切的氨基酸，從而發(fā)揮這些新功能。”
      

      氨基酸是蛋白質(zhì)的基本成分。它們特定的線性排列決定了蛋白質(zhì)的特性，它們在蛋白質(zhì)表面的簇作為接觸，調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)和分子的相互作用。Lundblad和她的同事們懷疑，盡管幾十年的工作破譯了蛋白質(zhì)的奧秘，但蛋白質(zhì)表面上這種調(diào)節(jié)環(huán)境的程度仍然大部分尚未開發(fā)。很久以前，她的小組意外地發(fā)現(xiàn)了一個這樣的調(diào)節(jié)氨基酸簇，同時逐個搜索300,000個突變酵母細(xì)胞。雖然這項工作開辟了端粒生物學(xué)領(lǐng)域的一個新研究領(lǐng)域，但倫德布拉德決心找出一種更強大的方法，可以迅速發(fā)現(xiàn)更多這些未開發(fā)的蛋白質(zhì)表面。
      

      進(jìn)入John Luin，現(xiàn)在是Lundblad實驗室的博士生，她開始和她一起做本科生。
      

      “我的任務(wù)是弄清楚如何搜索30個突變酵母細(xì)胞，而不是300,000，以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的新活動，”該論文的共同第一作者魯賓說。Timothy Tucey，另一位共同第一作者，是Lundblad小組的博士后研究員，現(xiàn)在在蒙納士大學(xué)。
      

      他們一起轉(zhuǎn)向了一種名為Est1的蛋白質(zhì)，Lundblad在1989年作為博士后研究員在酵母中發(fā)現(xiàn)了它.Est1是一種稱為端粒酶的蛋白質(zhì)(一種酶)的亞基，它將保護(hù)帽保留在染色體的末端(稱為端粒)從太短。作為第一個被發(fā)現(xiàn)的端粒酶亞基，Est1已經(jīng)受到許多研究小組的深入研究。
      

      Salk團隊的方法包括在酵母細(xì)胞中引入一小組但定制的突變，這些突變會選擇性地破壞細(xì)胞Est1蛋白上的表面接觸。然后，研究小組分析了細(xì)胞，看看各種突變有什么影響。由特定突變引起的異常將表明未突變版本的作用是什么。為此，他們使用遺傳技巧，通過用每種突變蛋白充滿細(xì)胞，并尋找可能干擾細(xì)胞功能的罕見突變蛋白，因為他們之前的工作表明這將優(yōu)先靶向蛋白質(zhì)表面。
      

      Lundblad的團隊通過這種方法為Est1發(fā)現(xiàn)了四個功能?？茖W(xué)家們發(fā)現(xiàn)，通過對Est1表面氨基酸的突變，這四種功能中的任何一種功能受損，導(dǎo)致端粒嚴(yán)重短的細(xì)胞，表明端粒酶復(fù)合物中Est1接觸的特定作用。
      

      “我們對這種技術(shù)感到興奮的是，它可以應(yīng)用于眾多蛋白質(zhì)，”Lundblad說。“特別是，許多治療藥物依賴于能夠進(jìn)入蛋白質(zhì)表面的非常特定的位置，我們懷疑這種方法可以通過這種方法發(fā)現(xiàn)。”
      

      使用這種方法，她的團隊已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一組調(diào)節(jié)基因組穩(wěn)定性的蛋白質(zhì)的新功能，并且還申請了資助研究藥物靶標(biāo)的資助。
      
			

			
        
      
			
      
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