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      成千上萬的基因在生活在奶酪上的微生物群落中交換
      
			
      
				2019-06-06 09:41:01
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      加州大學(xué)圣地亞哥分校的研究人員發(fā)現(xiàn)，生活在奶酪上的微生物物種之間已經(jīng)傳播了數(shù)千種基因。他們還確定了進(jìn)行此類交換的區(qū)域熱點(diǎn)，包括幾個(gè)基因組“島嶼”，它們交換了幾種細(xì)菌。
      

      成千上萬的基因在生活在奶酪上的微生物群落中交換
      

      加州大學(xué)圣地亞哥分校生物科學(xué)系的博士后研究員Kevin Bonham和助理教授Rachel Dutton以及現(xiàn)在塔夫茨大學(xué)Dutton實(shí)驗(yàn)室的前博士后研究員Benjamin Wolfe使用手工奶酪品種的種類作為研究微生物組的簡(jiǎn)單模型系統(tǒng)，或微生物群落。眾所周知，微生物在許多領(lǐng)域發(fā)揮關(guān)鍵作用，包括人類健康，保護(hù)我們免受某些疾病的侵害，并擴(kuò)大其他疾病。
      

      奶酪外皮提供了一種新方法來研究微生物群落中的基因如何在稱為“水平基因轉(zhuǎn)移”的過程中從一種生物體傳遞到另一種生物體。研究詳情于7月25日在eLife雜志上發(fā)表。
      

      “我們檢查了來自奶酪的150多種細(xì)菌的基因組，發(fā)現(xiàn)了4,000多種基因，這些基因在細(xì)菌物種之間共享，包括許多物種共有的幾個(gè)大基因組島，”分子生物學(xué)部助理教授Dutton說。加州大學(xué)圣地亞哥分校的微生物群創(chuàng)新中心的一部分，該中心利用該大學(xué)在臨床醫(yī)學(xué)，生物工程，計(jì)算機(jī)科學(xué)，生物和物理科學(xué)，數(shù)據(jù)科學(xué)和其他領(lǐng)域的優(yōu)勢(shì)來協(xié)調(diào)和加速微生物組研究。“水平基因轉(zhuǎn)移已經(jīng)研究了幾十年，但在更自然的背景下檢查它是具有挑戰(zhàn)性的，因?yàn)樗枰芯空麄€(gè)微生物群落，而不是孤立地研究它們。”
      

      Dutton表示，大部分轉(zhuǎn)移基因涉及獲取營養(yǎng)物質(zhì)的功能，特別是鐵，已知其在奶酪表面供不應(yīng)求。鐵的競(jìng)爭(zhēng)是許多環(huán)境中微生物的重要主題，包括病原微生物對(duì)人類的感染。
      

      “水平基因轉(zhuǎn)移可能會(huì)影響對(duì)鐵的競(jìng)爭(zhēng)，并可能使混合社區(qū)內(nèi)的'作弊'，”達(dá)頓說。
      

      根據(jù)新的結(jié)果，Dutton和她的同事正在探討水平基因轉(zhuǎn)移的復(fù)雜動(dòng)態(tài)以及這一過程如何在奶酪上展開。
      

      “由于水平基因轉(zhuǎn)移在許多微生物群落中普遍存在，包括那些對(duì)人類健康很重要的微生物群落，我們現(xiàn)在正試圖研究這一過程如何影響社區(qū)中的微生物生命和死亡，”Dutton說。
      
			

			
        
      
			
      
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