組成腸道微生物組是一個由宿主驅(qū)動的項目
烘烤酵母面包需要起始劑,哺乳動物腸道也是如此,它們首先被母親的微生物群落定殖,然后隨著時間的推移獲得更多的微生物。這些腸道微生物群落對于保持健康和抗擊疾病非常重要,這就是為什么美國國立衛(wèi)生研究院于2008年發(fā)起的人類微生物群項目正在通過測序和組裝參考目錄來研究填充人體的微生物群落。這涉及美國能源部(DOE)聯(lián)合基因組研究所(JGI)的研究人員。
當(dāng)HMP開始實施時,亞利桑那大學(xué)的DOE JGI合作者Howard Ochman專注于一個單獨但相關(guān)的問題:確定腸道微生物組是否受宿主或飲食等環(huán)境因素的影響更大。在11月16日在線發(fā)表于PLoS Biology的研究中,Ochman及其同事,包括前DOE JGI科學(xué)家Phil Hugenholtz,現(xiàn)任澳大利亞昆士蘭大學(xué)澳大利亞生態(tài)基因組學(xué)中心主任,研究了幾種靈長類動物的腸道微生物群落并進(jìn)行了比較它們是兩個人的腸道微生物群。結(jié)果表明,宿主,而不是飲食或地理等環(huán)境因素,對這些微生物群落的構(gòu)成影響最大。
使用從非洲本土收集的糞便樣本,Ochman和他的同事對幾種靈長類動物 - 東部和西部低地大猩猩,倭黑猩猩和三種黑猩猩亞種 - 的腸道中的微生物群落進(jìn)行了測序,以確定它們的成分構(gòu)成,并將結(jié)果與來自人類采集的樣本。他們發(fā)現(xiàn)腸道微生物群落是物種特異性的,并且在進(jìn)化時間尺度上跟蹤它們的宿主。即使腸道社區(qū)受到諸如疾病等因素的干擾,這種進(jìn)化信號似乎也是可辨別的。
“宿主系統(tǒng)發(fā)育是決定巨猿腸道微生物群微生物組成的最重要因素,”Ochman和他的同事們在他們的研究中得出結(jié)論,并補充說這一發(fā)現(xiàn)與之前的觀點形成鮮明對比,即飲食是控制靈長類動物腸道微生物的最重要因素。 “。
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