今年5月，“紐約時報”對此進(jìn)行了暗示，報道了兩項新的研究，詳細(xì)介紹了子宮內(nèi)膜癌的基因組景觀和一種稱為急性髓性白血病(AML)的白血病。泰晤士報 - 承認(rèn)這些研究結(jié)果顯示子宮內(nèi)膜癌，卵巢癌和乳腺癌之間存在巨大的相似性 - 這表明這是“最有說服力的證據(jù)，即癌癥將越來越多地被視為一種主要由其基因指紋定義的疾病，而不僅僅是它所在的器官。起源“。

提到的這兩項研究是癌癥基因組圖譜(TCGA)的一部分，這是一項耗資數(shù)百萬美元的努力，于2008年開始解決許多類型癌癥背后的基因組畸變。TCGA是由國家癌癥研究所(NCI)和國家人類基因組研究所(NHGRI)共同支持和管理的合作，這兩個研究所都是美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)的兩個部分。

由于TCGA研究論文發(fā)表在個體癌癥 - 膠質(zhì)母細(xì)胞瘤，乳腺癌，卵巢癌和其他癌癥 - 并且基因組數(shù)據(jù)開始積累，研究人員開始注意到癌癥的相似性，混亂中的模式。每個“標(biāo)記紙”都有其驚喜，例如新基因突變和新的癌癥亞型。但是，經(jīng)常和預(yù)期的一樣，研究人員反復(fù)遇到了行為不端的基因和途徑的相同字母湯 - TP53，RAS / RTK和HER2，僅舉幾例 - 主要是破壞對細(xì)胞分裂，生長和發(fā)育的控制。

正如歷史上所做的那樣，科學(xué)家們現(xiàn)在正在尋找一種新的方法來匯集所有這些信息并查看疾病類型之間的共性，而不是通過器官部位對每個癌癥進(jìn)行孤立。這個主題 - 癌癥之間的相似性 - 是一個名為泛癌癥倡議的項目的核心。

Pan-Cancer于2012年推出，是TCGA研究的下一個合乎邏輯的步驟。9月，Pan-Cancer項目獲得了來自12種癌癥類型的5,000多種腫瘤樣本的TCGA基因組數(shù)據(jù)，并在幾家期刊的出版物中向全世界宣布。

第一輪泛癌論文包括Nature Genetics的兩篇研究論文除其他外，這表明有限數(shù)量的基因改變是大多數(shù)癌癥亞型的原因，并且突變最常發(fā)生在基因組的某些區(qū)域。在最新的泛癌研究中，研究人員調(diào)查了來自21種不同癌癥類型的近5,000種腫瘤，揭示了超過30種新的癌癥基因。他們的結(jié)果 - 在1月5日在線報道的自然 - 表明還有更多的癌癥基因尚待鑒定，這意味著需要分析其他腫瘤樣本和癌癥類型以開發(fā)全面的癌癥基因目錄。這樣的目錄可能最終有助于塑造個人治療方法。

雖然TCGA標(biāo)記論文繼續(xù)發(fā)現(xiàn)更多針對個體癌癥的潛在藥物靶點，但泛癌報告越來越多地創(chuàng)建了跨越癌癥的地形圖，生物山脈和山谷，繪制了治療可能采取的道路。這些地圖有可能改變研究人員和臨床醫(yī)生理解和攻擊癌癥的方式。當(dāng)研究人員指出有罪的癌癥基因，蛋白質(zhì)和途徑時，他們也希望了解他們的行為并學(xué)習(xí)如何控制癌癥過程。他們希望從不同的有利位置發(fā)起全球攻擊，而不是攻擊個別基因或蛋白質(zhì)目標(biāo)。

“Pan-Cancer項目首次向我們展示了癌癥之間的不同和共同之處，并幫助我們將所有內(nèi)容都放在一個共同的圖片中，”May Goldman Shaw杰出教授Charles Perou博士說。分子腫瘤學(xué)，北卡羅來納大學(xué)教堂山分校Lineberger綜合癌癥中心的遺傳學(xué)，病理學(xué)和實驗室醫(yī)學(xué)教授。“這是為未來的研究和治療策略奠定基礎(chǔ)的基本信息。”

例如，他說，科學(xué)家和臨床醫(yī)生“暗示基底樣亞型乳腺腫瘤，卵巢和肺鱗癌多年來有相似之處，但現(xiàn)在我們可以說基因組變化 - 基因p53的變化，基因拷貝和表達(dá)簽名的數(shù)量 - 在這三個群體中一起被看到并且是獨一無二的。“

乳腺癌專家Perou博士說，大多數(shù)”明顯可藥物的目標(biāo)“是已知的。”現(xiàn)在，我們正處于下一階段，研究其他更為間接的途徑，以及整個染色體區(qū)域，而不僅僅是單個基因。泛癌研究正在幫助我們將這些新型目標(biāo)置于更大的癌癥圖片中。“

新的治療方法，臨床試驗

科學(xué)家和臨床醫(yī)生希望泛癌研究最終將有助于為新的治療方法提供見解，盡管這些方法將是多方面的，而不是一種通用的癌癥治療方法。

“盡管我們看到了許多交叉模式，但如果你看看100名患有相同類型癌癥的患者，你會發(fā)現(xiàn)許多相似之處和不同之處。癌癥的道路很多，”理查德威爾遜博士，導(dǎo)演說。圣路易斯華盛頓大學(xué)基因組研究所

腫瘤的基因組分析已經(jīng)成為常規(guī)的腫瘤學(xué)實踐，特別是在一些較大的中心。患者可以通過一系列已知的突變和改變來描述他們的腫瘤，并且可以排除某些療法，并且其他人嘗試過。

Perou博士說，TCGA泛癌研究和腫瘤的其他基因組分析可能意味著新的分類 - 在某些情況下，癌癥診斷和治療的變化 - 可能意味著多達(dá)15%的癌癥患者?？梢愿鶕?jù)這些較新的分類重新制定臨床試驗。

紐約Memorial Sloan-Kettering癌癥中心(MSKCC)的婦科腫瘤學(xué)家Douglas Levine醫(yī)師表示，在某些情況下，臨床試驗已經(jīng)開始發(fā)生變化。Levine博士幫助領(lǐng)導(dǎo)了針對卵巢癌和子宮內(nèi)膜癌的TCGA項目。例如，在一些較大的機構(gòu)中，早期臨床試驗的入選率較少基于受癌癥影響的腎，肺，結(jié)腸或其他器官部位，而更多地取決于腫瘤中所見的特定基因組異常。

在MSKCC和其他地方，一種新的方法是“籃子”試驗。這些試驗不是僅通過原發(fā)部位來治療疾病的亞型，而是測試藥物對許多不同癌癥中所見的特定分子異常的有效性。在一項試驗中，患有不同類型癌癥的患者可以分為相似或單獨的籃子。

“在一次籃子試驗中，我們會描述患者的腫瘤，患者最終會進(jìn)入HER2，BRAF，EGFR或其他一些突變籃，”Levine博士說。雖然HER2基因擴增 - 意味著HER2基因在細(xì)胞中有額外的拷貝- 有助于驅(qū)動25%的乳腺癌，HER2突變基因也存在于少數(shù)乳腺癌中。然而，在一些膀胱癌，肺癌和胃癌中也發(fā)現(xiàn)了相同的改變。

不保證這些相似性會對患者護(hù)理產(chǎn)生影響。臨床醫(yī)生和臨床研究必須表明，相同的藥物或藥物混合物對在不同癌癥中攜帶相同關(guān)鍵基因組改變的患者具有相似的影響。例如，對攜帶BRAF基因突變的黑素瘤有效的藥物在具有相同突變的結(jié)腸癌中不能很好地起作用。

“Pan-Cancer已經(jīng)突出了許多癌癥常見的途徑，并且繼續(xù)研究將提供一種方法來剖析這些途徑并幫助提供線索，為什么一種腫瘤對藥物有反應(yīng)，但其他人沒有，”Levine博士說。“為了幫助我們的患者，我們希望了解誰在回應(yīng)以及為什么。”