極端微生物植物的基因組測序

Thellungiella parvula是一種能夠在惡劣條件和貧瘠資源的棲息地中生存的植物 - 極端微生物。來自美國，沙特阿拉伯和韓國的一組研究人員使用新一代DNA測序工具來組裝該物種的基因組草圖，以了解它如何進化出其強壯的性格。

研究人員將 T. parvula與擬南芥(Arabidopsis thaliana)進行了比較，擬南芥是一種近似相似的基因組，具有類似大小的基因組，但對其有壓力敏感性。他們在Nature Genetics上發(fā)表了他們的發(fā)現(xiàn) 。

這兩種植物的遺傳信息差異很大，主要是通過基因的串聯(lián)重復(fù)。許多這些重復(fù)的基因負責編碼在惡劣環(huán)境中T.plavula存活所必需的功能。相比之下，擬南芥中存在的重復(fù)基因適合潮濕，涼爽的環(huán)境。

這些重復(fù)基因的性質(zhì)意味著它們可能在T. parvula的進化中起到了耐受壓力的作用。研究人員認為，詳細檢查基因組結(jié)構(gòu)及其復(fù)雜基因，分析重復(fù)基因編碼的酶，特別是與壓力敏感植物相比，可以幫助我們了解T. parvula如何在惡劣條件下繁衍生息。這可以幫助科學(xué)家在作物植物中建立應(yīng)激防御，這種植物通常無法在壓力環(huán)境中生長。

“植物的干旱和耐鹽性已經(jīng)研究了幾十年，基因工程對一些基因的修飾幾乎沒有取得進展，”伊利諾伊大學(xué)厄巴納 - 香檳分校的植物生物學(xué)家Maheshi Dassanayake說。該論文的作者。“通過 T. parvula基因組，我們更接近于了解自然界對干旱，鹽度，寒冷和低營養(yǎng)土壤的解決方案，并使成功的策略適應(yīng)我們的作物植物。”

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