TCGA研究揭示了前列腺癌基因組多樣性的新線索
根據(jù)癌癥基因組圖譜(TCGA)網(wǎng)絡(luò)的一項(xiàng)研究,前列腺癌的新發(fā)現(xiàn)可能使醫(yī)生能夠?yàn)榛颊咦龀龈玫脑\斷和預(yù)后,并為治療提供新方向。調(diào)查人員于2015年11月5日在線發(fā)表了對(duì)333例前列腺癌腫瘤的深入分析。TCGA由國(guó)家人類基因組研究所和國(guó)家癌癥研究所共同支持和管理,這兩個(gè)研究所都是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的一部分。
據(jù)美國(guó)癌??癥協(xié)會(huì)稱,2015年美國(guó)將有超過(guò)220,000名男性新診斷為前列腺癌,這使其成為影響男性的第二大常見癌癥,也是男性癌癥死亡的第二大原因。大多數(shù)前列腺癌早期被檢測(cè)到,但仍然局限于前列腺,位于膀胱下方的核桃大小的腺體。雖然大多數(shù)病例仍然是無(wú)害的 - 良性 - 幾十年來(lái),其他前列腺癌亞型可能具有攻擊性,并擴(kuò)散到身體的其他部位(轉(zhuǎn)移),使它們極難治療。目前,醫(yī)療服務(wù)提供者很難區(qū)分哪些癌癥將保持無(wú)害,哪些癌癥會(huì)轉(zhuǎn)移。
“直到現(xiàn)在,我們還沒(méi)有一種可靠的方法來(lái)預(yù)測(cè)原發(fā)性前列腺癌通過(guò)觀察基因組的方式,”紀(jì)念斯隆計(jì)算生物學(xué)項(xiàng)目首席研究員兼主席Chris Sander博士說(shuō)。 Kettering癌癥中心在紐約。“TCGA研究為我們提供了有關(guān)腫瘤改變范圍的更多信息,可以幫助我們預(yù)測(cè)疾病的發(fā)展。這也將為新臨床試驗(yàn)的設(shè)計(jì)提供信息。”
TCGA研究人員研究了前列腺癌腫瘤的五個(gè)方面:
基因突變的數(shù)量和種類。
基因融合(當(dāng)基因相互連接或以其他方式結(jié)合時(shí))。
DNA片段的拷貝數(shù)(細(xì)胞DNA片段拷貝數(shù)的異常差異可能導(dǎo)致癌癥)。
基因活動(dòng),包括何時(shí)打開或關(guān)閉基因,以及看到多少活動(dòng)。
DNA甲基化(甲基化學(xué)基團(tuán)被添加到細(xì)胞DNA上的許多位置,并像基因的開/關(guān)開關(guān)一樣)。DNA甲基化中的錯(cuò)誤可以在錯(cuò)誤的時(shí)間打開或關(guān)閉基因并導(dǎo)致癌癥。
研究人員 - 包括共同主要研究人員Nikolaus Schultz,博士,瑪麗 - 何塞知識(shí)系統(tǒng)負(fù)責(zé)人和MSKCC分子腫瘤學(xué)Henry R. Kravis中心,以及分子腫瘤病理學(xué)中心主任Massimo Loda博士波士頓的Dana-Farber / Brigham和女性癌癥中心根據(jù)這些方面確定了七種癌癥或腫瘤亞型。在這7個(gè)亞型中,研究人員發(fā)現(xiàn)其中4個(gè)以基因融合為特征,而其他3個(gè)亞型則由SPOP,F(xiàn)OXA1和IDH1基因的突變定義。具有SPOP和FOXA1的亞型 突變具有幾種基因組特征,表明這些基因的突變導(dǎo)致細(xì)胞中的類似破壞導(dǎo)致癌癥。
研究人員發(fā)現(xiàn),IDH1基因的突變與白血病和腦癌中的突變相似。這種癌癥亞型可以是“籃子”臨床試驗(yàn)的候選者,其測(cè)試跨癌癥類型的類似突變。這種類型的試驗(yàn)的目標(biāo)是基于突變而不是癌癥的解剖位置來(lái)個(gè)性化患者的治療。
Sander博士表示,雖然之前的研究已經(jīng)檢查了基因拷貝數(shù)或基因突變的數(shù)量和種類或前列腺腫瘤中的基因活性水平,但TCGA研究是第一個(gè)全面系統(tǒng)地檢查多種不同類型數(shù)據(jù)的研究。規(guī)模大。
“我們之前對(duì)基因和癌癥改變的理解與這些新基因組細(xì)節(jié)的整合使我們更有信心,這些新的前列腺腫瘤分類將在臨床中用于預(yù)后和亞型的治療,”Sander博士說(shuō)。
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