牦牛基因組測序
由中國蘭州大學領導的國際研究團隊完成了雌性家牦牛的基因組序列。
作為西藏的標志性象征,牦牛,Bos gr,是中國青海省生活在高海拔地區(qū)的西藏人最重要的馴化物種,可以提供肉類和其他基本資源,如牛奶,運輸,干糞燃料,并隱藏帳篷住宿。
牦牛具有許多解剖學和生理學特征,使它們能夠生活在高海拔地區(qū),包括高代謝,急性感覺,令人印象深刻的覓食能力,心臟和肺部增大,以及當面對相對較低的氧氣條件時肺部缺乏血管收縮。
研究人員使用高通量測序技術對雌性家牦牛的基因組進行了測序。基因組數(shù)據(jù)產(chǎn)生2,657Mb草牦?;蚪M組裝,覆蓋率為65倍。他們還對來自同一牦牛的新鮮心臟,肝臟,腦,胃和肺組織的RNA樣品進行了轉錄組測序。基于轉錄組數(shù)據(jù),研究人員估計牦牛基因組包含22,282個蛋白質編碼基因和220萬個雜合SNP。結果發(fā)表在Nature Genetics上。
為了了解牦牛在高海拔地區(qū)的進化適應性,該團隊對牦牛和牛進行了比較基因組分析,這是一種通常生活在低海拔地區(qū)的密切相關的動物。雖然牦牛和牛估計在490萬年前分化,但許多牦牛和?;蛉匀环浅O嗨?,這兩種動物共享45%的蛋白質特性和99.5%的蛋白質相似性。
然而,他們發(fā)現(xiàn)了與牦牛中感官知覺和能量代謝相關的不同基因擴增。
研究人員還發(fā)現(xiàn)了與細胞外環(huán)境和低氧應激相關的蛋白質結構域的富集。特別是,他們發(fā)現(xiàn)牦牛中與缺氧和營養(yǎng)代謝相關的直系同源基因經(jīng)歷了正向選擇和快速進化。
關于牦牛高海拔適應性的研究可能有助于改善目前對人類高原反應和其他缺氧相關疾病的理解,治療和預防。此外,牦?;蚪M為加速這種重要動物的牛奶和肉類生產(chǎn)的遺傳改良提供了寶貴的資源。
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