核DNA分析推動捕撈配額
幾十年來,線粒體DNA分析一直是用于決定捕撈配額,剔除,狩獵配額或將動物從一個受威脅物種遷移到另一個群體的主要方法。
發(fā)表在“科學報告”上的一項研究表明,雖然線粒體DNA分析對許多應用非常有用,但為保護目的分析遺傳差異并不是其中之一。該研究強調了以前未被認識的沙丁魚種群之間的遺傳差異。
在這項研究中,研究人員分析了南半球沙丁魚在南非西海岸和南部海岸捕獲的線粒體DNA。
“線粒體DNA結果表明,在其范圍的一部分過度捕撈物種不會產生重大問題,因為人口將很快從其他地方補充。但是當我們通過對大部分核基因組進行測序來分析更多的沙丁魚基因時,一幅完全不同的畫面出現(xiàn)了,“約翰內斯堡大學生態(tài)基因組學和野生動物保護中心的Peter Teske教授說。
在這項研究中,研究人員分析了南半球沙丁魚(一種商業(yè)開發(fā)的魚類)的線粒體DNA和核DNA,以及一種小型特有魚,其范圍與沙丁魚相同。
兩種DNA
動物或植物中的每個活細胞含有兩種DNA來源。線粒體DNA(mtDNA)很容易從每個細胞內的線粒體中獲得。mtDNA只有幾十個基因,因此序列快速而經濟。
但核DNA(nDNA)使用起來要困難得多且昂貴。它只存在于每個細胞的細胞核內。nDNA可含有數(shù)萬種基因,具體取決于物種。幸運的是,今天的測序成本只是幾年前的一小部分。
成本直線下降
該中心的博士后研究員Arsalan Emami-Khoyi說:“首先,對整個人類核基因組進行測序需要花費數(shù)十億美元,然后花費大約10年時間完成研究人員聯(lián)合會。”
“如今,有可能在一小時內對整個人類核基因組進行測序,價格不到一千美元。因此,我們的中心將核DNA測序合??并到商業(yè)實驗室。來自nDNA測序的千兆字節(jié)數(shù)據(jù)不需要投資我們自己的基礎設施 - 他們在開普敦的國營高性能計算中心進行了分析,“他補充道。
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