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      研究資源標識符可改善生物醫(yī)學研究中細胞系的正確使用
      
			
      
				2019-02-18 09:24:30
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      根據(jù)eLife今天發(fā)表的一項研究，使用研究資源標識符(RRID)有助于減少生物醫(yī)學研究中細胞系的不當使用。研究結(jié)果表明，在科學文獻中繼續(xù)使用RRID 可以更好地報告出版物中的細胞系和其他研究材料，從而有助于未來的重復性工作。
      

      研究資源標識符可改善生物醫(yī)學研究中細胞系的正確使用
      

      細胞系廣泛用于生物科學。它們無限繁殖的能力意味著科學家在理論上可以完全復制以前的研究并在結(jié)果的基礎(chǔ)上進行。但錯誤標記或錯誤處理可能導致有問題的細胞系的錯誤識別，污染和/或分布，這反過來又會影響研究數(shù)據(jù)的有效性。
      

      “RRID應該有助于減少這種細胞系的不當使用，”共同第一作者Zeljana Babic解釋說，他是美國加利福尼亞大學圣地亞哥分校生物系統(tǒng)研究中心的研究生。“這些獨特的標識符可以包含在研究論文的方法部分中，以定義細胞系，抗體，轉(zhuǎn)基因生物或使用的軟件。它們可以提醒研究人員注意標記有問題的細胞系的資源，例如Cellosaurus數(shù)據(jù)庫。”
      

      “Cellosaurus數(shù)據(jù)庫是細胞系中最全面的知識資源，”日內(nèi)瓦大學教授，瑞士生物信息學研究所組長Amos Bairoch說。“細胞系的RRID由此權(quán)威數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建。”
      

      國際細胞系認證委員會(ICLAC)主席Amanda Capes-Davis補充說：“錯誤鑒定的細胞系是科學文獻中的一個主要問題。如果研究人員在發(fā)表細胞系之前對其進行錯誤識別，他們是否還會報告來自這種細胞系的數(shù)據(jù)?“
      

      在他們的研究中，該團隊使用自然語言處理算法來文本挖掘PubMed Central中約200萬篇科學論文的方法部分。他們使用該算法識別包含RRID的文章和列出細胞系的文章，然后比較這兩個樣本中錯誤識別的細胞系出現(xiàn)的頻率。
      

      他們在150,459篇文章中確定了305,161個獨特的細胞系名稱，并估計其中8.6%屬于有問題的細胞系列表。另一方面，包含RRID的634篇論文中只有3.3%的細胞系存在問題列表中。這表明使用RRID與較低報告的有問題細胞系的使用相關(guān)。
      

      “但在解釋這些結(jié)果時我們必須謹慎行事，”資深作者Anita Bandrowski解釋說，他是加州大學圣地亞哥分校生物系統(tǒng)研究中心SciCrunch和項目主管的首席執(zhí)行官。“在有問題的清單上使用細胞系不會自動意味著給定的生產(chǎn)線使用不當。此外，該清單還包括標有錯誤癌癥類型的細胞系，但如果使用的話仍可安全使用研究人員知道這條線的真實身份。“
      

      該團隊補充說，重要的是要審查調(diào)查結(jié)果所依據(jù)的證據(jù)，并對其對已發(fā)表工作的影響做出深思熟慮的判斷。“細胞系資源，如Cellosaurus和ICLAC登記的錯誤識別的細胞系，已被開發(fā)用于提高對細胞系信息的認識，”Bandrowski總結(jié)道。“我們希望包含RRID將改善這些資源的使用，并在未來的出版物中更好地報告所有研究材料。”
      
			

			
        
      
			
      
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