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      對瀕臨滅絕的kakapo的基因組進行測序
      
			
      
				2019-01-29 11:47:14
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      一個由基因測序科學(xué)家組成的國際團隊，包括杜克大學(xué)的一些科學(xué)家， 想要對所有活著的kakapo - 一種極度瀕危的新西蘭不會飛的鸚鵡 - 的基因組進行測序 - 而世界上仍然有125只。這是第一個旨在對特定物種的每個成員進行排序的項目?？茖W(xué)家及其合作者希望公眾能夠通過群眾資助來幫助他們。他們希望籌集45,000美元美元，而且還有一半多一點。僅剩2個半月，你可以幫助寫下這個故事的結(jié)尾。
      

      對瀕臨滅絕的kakapo的基因組進行測序
      

      四年前，杜克研究專家杰森·霍華德從圖書館拿起一本兒童讀物給他6歲的女兒讀書。它是關(guān)于kakapo(Strigops habroptilus)，一種不會飛的，夜間鸚鵡，聞起來像蜂蜜。
      

      霍華德在霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究員的神經(jīng)生物學(xué)家埃里希賈維斯的杜克醫(yī)學(xué)實驗室工作，他正在共同領(lǐng)導(dǎo)一項大規(guī)模的持續(xù)努力，對所有10,000種鳥類的基因組進行測序。所以，霍華德的圖書館書籍選擇并不是隨機的。(事實上??，他當時對鸚鵡基因組進行了測序。)
      

      但是，當霍華德讀到關(guān)于拯救這個心愛的人群和快速老化的鳥類的努力時，他問他的女兒是否認為他應(yīng)該把卡卡波的基因組作為優(yōu)先事項。(她說，“是的，爸爸，做吧!”)霍華德能夠從卡卡波獲得DNA樣本，這本身就是一項壯舉，并獲得了序列的草稿。“但三年前的測序技術(shù)并沒有那么好，而且價格昂貴得多，”他說。
      

      他想獲得更高質(zhì)量的基因組并研究個體的基因組，部分原因是因為剩下的kakapo很少。因為這只鳥是最古老的鸚鵡種類之一，它也可以讓賈維斯的實驗室更好地理解聲樂學(xué)習(xí)和語音模仿的演變，他們的許多研究都集中在這里。
      

      即使在過去的一年中，基因組測序的進展已經(jīng)回應(yīng)了該組希望更詳細的kakapo基因組的愿望。賈維斯的實驗室完成了一個名叫簡的卡卡波的基因組; 他們所謂的“參考”基因組將允許他們更簡單，更便宜地拼湊其他個體kakapo的序列。他們只需要資金來做更多事情。幸運的是，分子生態(tài)學(xué)家Bruce Robertson，奧塔哥大學(xué)的副教授，新西蘭保護部的Andrew Digby和遺傳救援基金會的David Iorns接近霍華德，當時他正在研究Jane的基因組，關(guān)于資助并眾包一個項目，以序列所有剩余的kakapo?；羧A德說：“我從未夢想過全力以赴。”
      

      從20世紀80年代開始的保護工作已經(jīng)采用了育種策略來促進人口減少，但是隨著個體基因組的掌握，該小組將能夠了解哪些kakapo具有對特定疾病的遺傳易感性，并且能夠更有效地培育它們以產(chǎn)生更多的后代。強大的免疫系統(tǒng)。(有一天，科學(xué)家甚至可以使用基因編輯技術(shù)修改易受疾病影響的基因。)基因組還可以讓他們研究這些鳥類中低生育力的任何遺傳原因，這些原因只能間歇性地交配。
      

      卡卡波目前居住在新西蘭兩個小島嶼的野外，因為人類引進的捕食者，包括貓和狗，都是在大陸上運行的。
      

      Kakapo Recovery可以從已經(jīng)滅絕的地區(qū)獲取死亡鳥類的博物館樣本，包括近200年前的一些。如果該項目資金充足，他們可以利用這些博物館標本，以更好地了解各種島嶼種群和可能的死亡線索。
      

      截至2月15日，該團隊的眾籌工作已達到150多名支持者，但他們希望看到更多的捐款。要了解有關(guān)kakapo的更多信息，請查看Kakapo恢復(fù)和遺傳救援基金會。
      
			

			
        
      
			
      
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