線索可可發(fā)酵病原體的先天耐藥性
乍一看,酵母Candida krusei看起來(lái)像微生物一樣無(wú)害:它用于發(fā)酵可可豆,給巧克力帶來(lái)令人愉悅的香氣。但它越來(lái)越多地被發(fā)現(xiàn)作為免疫功能低下患者的病原體 - 而克魯氏菌感染并不總是容易治愈。這種酵母天然對(duì)氟康唑具有抗性,氟康唑是一種抗真菌藥物,不僅對(duì)治療許多真菌感染至關(guān)重要,而且對(duì)易感人群也有預(yù)防作用。在G3的9月號(hào)中,Cuomo等人。揭示了C. krusei臨床樣本的第一個(gè)全基因組序列,提供了對(duì)該物種的氟康唑抗性可能很重要的基因的引導(dǎo)。
C. krusei基因組的一些組裝草稿是在這些研究人員的工作之前產(chǎn)生的,但是它們是碎片化的,這是由大量雜合性引起的問(wèn)題。他們成功的關(guān)鍵是產(chǎn)生長(zhǎng)的測(cè)序讀數(shù),產(chǎn)生一個(gè)比C沒(méi)有更多支架的組裝.krusei有染色體。
隨著他們的新選秀,Brand等人。在C. kruseigenome中搜索了與更熟悉的白色念珠菌發(fā)病相關(guān)的基因 - 鵝口瘡,陰道酵母菌感染的原因,以及有時(shí)可能致命的全身性感染。他們發(fā)現(xiàn),C.krusei幾乎沒(méi)有與白色念珠菌發(fā)病相關(guān)的基因家族拷貝,包括寡肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,天冬氨酰蛋白酶和磷脂酶B基因。常常引起疾病的念珠菌物種通常在這些基因家族中具有擴(kuò)增,因此鑒于C. krusei很少致病,這一發(fā)現(xiàn)是有意義的。
當(dāng)他們關(guān)注與抗藥性相關(guān)的基因時(shí),該研究小組發(fā)現(xiàn)C. krusei與白色念珠菌不同;許多在抗性白色念珠菌中的唑類藥物靶標(biāo)中經(jīng)常突變的位點(diǎn)在克魯氏菌中沒(méi)有突變。這意味著可可發(fā)酵酵母對(duì)氟康唑的天然抗性來(lái)自與通常允許白色念珠菌抵抗唑類藥物的機(jī)制不同的機(jī)制。
研究人員還沒(méi)有找到基因MDR1,它編碼一種藥物轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,通常負(fù)責(zé)對(duì)多種藥物的耐藥性。他們沒(méi)有,不過(guò),發(fā)現(xiàn)編碼相關(guān)聯(lián)的其它運(yùn)輸相關(guān)的CDR1,CDR2,和其他幾個(gè)基因的拷貝藥物耐藥,雖然他們?cè)诳巳崮钪榫倪\(yùn)作方式是未知的。這些基因可能是發(fā)現(xiàn)克柔念珠菌抗真菌耐藥機(jī)制的起點(diǎn),可能為高度脆弱的人群提供更好的治療和預(yù)防措施。
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