對植物有益的細菌遍布加利福尼亞
加利福尼亞大學(xué)河濱分校的科學(xué)家發(fā)現(xiàn),一種有益的固氮細菌菌株已遍布加利福尼亞,證明有益細菌可以分享一些與病原體相同的特征。稱為Bradyrhizobium的細菌在植物的根部形成腫瘤樣結(jié)節(jié),能夠通過分解氮來“固定”氮,并使其成為植物易于代謝的形式。
“細菌流行病很常見,但除了值得注意的病原體外,我們很少了解是什么驅(qū)使細菌在人群中傳播,”負責(zé)研究工作的生物學(xué)副教授喬爾薩克斯說。“為什么有些菌株會在流行病中蔓延,而其他菌株卻沒有得到很好的理解。”
薩克斯和他的團隊收集了來自加利福尼亞州寄主植物培養(yǎng)的350多個細菌結(jié)節(jié)的遺傳數(shù)據(jù)。研究人員關(guān)注的寄主植物是Acmispon strigosus,一種原產(chǎn)于美國西南部的常見草本植物,在加利福尼亞州幾乎連續(xù)不斷。
他們發(fā)現(xiàn)少數(shù)細菌菌株在當(dāng)?shù)刂参锓N群中占主導(dǎo)地位,并且遍布全州。
“這些細菌的基因組大致分為兩個區(qū)域,”薩克斯解釋說。“一個區(qū)域,染色體,主要是在細菌存在于土壤中的自由生存期間表達。另一個區(qū)域,稱為'共生島',在與植物宿主的共生相互作用中很重要 - 例如植物感染和氮我們發(fā)現(xiàn)這種流行病完全由細菌基因組的染色體區(qū)域驅(qū)動。“薩克斯指出,流行病菌株在土壤中和在感染植物的競爭中非常成功,這也許可以解釋為什么它們在許多不同的地方持續(xù)存在并占主導(dǎo)地位。
“傳播可能是通過土壤中的運動或通過風(fēng)暴發(fā)生的,”薩克斯說。
研究結(jié)果今天出現(xiàn)在英國皇家學(xué)會會刊B中。
研究人員還研究了哪些特性驅(qū)使流行病菌株能夠在如此多的地方持續(xù)存在,從而在不同的土壤中持續(xù)存在。他們在各種碳源(細菌的能量來源)上測試稀有流行病毒株和流行株。他們發(fā)現(xiàn),流行病菌株能夠處理比稀有菌株更多樣化的化合物。
“遺傳和碳使用數(shù)據(jù)與遺傳數(shù)據(jù)相結(jié)合表明,一種或兩種菌株在加利福尼亞州占主導(dǎo)地位,因為它們能夠在土壤中獲得成功,”薩克斯說。“在土壤中活躍的細菌的遺傳區(qū)域是唯一具有流行病傳播特征的區(qū)域。”
Bradyrhizobium是許多植物的重要共生體,特別是豆科植物。它們也是重要作物的重要共生體,包括大豆,花生和豇豆,并且是地球上所有生物體的氮營養(yǎng)素的主要來源。
根據(jù)Sachs的說法,利用本地流行病,例如在Bradyrhizobium中看到的流行病,可能是生物肥料開發(fā)的福音。
“幾十年來,農(nóng)藝師一直試圖將這些細菌用作生物肥料,”他說。“使用這些細菌來促進作物生長的想法非常有意義,因為Bradyrhizobium可以以可持續(xù)和自然的方式向植物提供游離氮。相比之下,化學(xué)肥料在化石燃料方面成本高昂,同時也是主要污染物。“
但他告誡說,試圖將細菌用作生物肥料的嘗試失敗了,因為接種菌株不能與土壤中的天然細菌競爭,最終無法成功感染植物。
“ 我們發(fā)現(xiàn)的流行病Bradyrhizobium菌株可以在各種土壤中存活并占主導(dǎo)地位,并且具有生物肥料中人們想要的關(guān)鍵特征,”他說。
該研究強調(diào)一些細菌菌株比其他細菌菌株更適合。它也表明,土壤中的競爭,而不是與植物宿主的共生,決定了哪些細菌菌株正在擴散。
薩克斯說:“生物學(xué)家對有益細菌的認識越來越高,但我們?nèi)匀徊涣私馑鼈兊某梢颉?rdquo; “通過更好地了解植物宿主上的有益細菌,我們可以開發(fā)出可以改善作物和生物燃料中這些相互作用的工具。”
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