研究人員對莫哈韋沙漠龜?shù)幕蚪M進行序列分析

亞利桑那州立大學領導的科學家團隊對莫哈韋沙漠龜(Gopherus agassizii)的基因組進行了測序，這是一種原生于莫哈韋沙漠的長壽物種。結果可以幫助動物在越來越多的威脅中存活下來。

莫哈韋沙漠龜是估計在大約3500萬年前在北美出現(xiàn)的六種沙漠龜之一，可以在加利福尼亞州，內華達州，猶他州和亞利桑那州找到。

這種物種也被稱為Agassiz的沙漠龜，受到棲息地喪失，呼吸道疾病和其他人為因素的嚴重影響。例如，該物種的一個區(qū)域的密度從1979年的約225個/ km2下降到1992年的約75個/ km2。

根據(jù)美國瀕危物種法案，莫哈韋沙漠龜被列為“受威脅”，被國際自然保護聯(lián)盟(IUCN)認為是“脆弱的”。

為了幫助保護該物種的遺傳多樣性，亞利桑那州立大學教授Kenro Kusumi及其合作者創(chuàng)建了一個全基因組參考序列，其基于成體骨骼肌，肺，腦和血液的深度轉錄組序列進行了注釋。

“莫哈韋沙漠龜基因組是保護這一物種的重要資源，特別是因為這一群體患有嚴重疾病，”共同作者Marc Tollis博士說，他也來自亞利桑那州立大學。

“研究人員還沒有完全了解它的原因或是什么讓龜易受它影響。”

“解碼這個基因組將幫助我們編制哪些龜基因正在迅速發(fā)展以幫助它們克服這種威脅。”

研究人員獲得了特定烏龜標本的遺傳數(shù)據(jù)，匯集并注釋了基因組，并了解了陸龜?shù)倪M化歷史。

“解碼基因組在技術上變得更加容易，”庫蘇米教授說。

“現(xiàn)在最具挑戰(zhàn)性的是解碼烏龜基因組中的信息。我們可以使用與小鼠和人類基因組相似的線索。“

“在大海撈針中尋找眾所周知的'針頭'將是識別導致免疫反應傳染病的基因，以及在莫哈韋沙漠的惡劣條件下生存的能力。”

“我們必須了解龜類多樣性在其地理范圍內的位置，”他補充說。

“確定遺傳多樣性的熱點有助于從保護的角度管理物種，并保護龜類種群，以便在未來幾年內更好地應對未知挑戰(zhàn)。”

該團隊還在分析莫哈韋沙漠龜及其姊妹物種索諾蘭沙漠龜(Gopherus morafkai)之間的遺傳差異。

“我的希望是，這項研究將使其他機構能夠提出新問題，這些問題是他們在沒有這項研究的情況下無法提出的問題，”共同作者，亞利桑那州立大學的Greer Dolby博士說。

“例如，'陸龜有什么免疫基因可以對抗病原體?他們的免疫系統(tǒng)如何在具有大量威脅的環(huán)境中發(fā)揮作用?而且，不斷變化的環(huán)境會如何影響這個?這些是管理物種時需要回答的重要問題?，F(xiàn)在，我們可以開始調查了。“

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