Warbler基因組看起來(lái)都是百分之99.97
幾十年來(lái),保護(hù)主義者一直認(rèn)為藍(lán)翅鶯對(duì)金翅鶯是一種威脅,這種鶯是一種被認(rèn)為可以保護(hù)聯(lián)邦瀕危物種的物種。根據(jù)北美育種鳥(niǎo)類調(diào)查,自1968年以來(lái),藍(lán)翅鶯數(shù)量下降了66%。眾所周知,這兩個(gè)物種經(jīng)常在它們共同發(fā)生的地方雜交,科學(xué)家一直擔(dān)心更多的藍(lán)翅鶯將遺傳地淹沒(méi)稀有的金翅基因庫(kù)。
來(lái)自康奈爾鳥(niǎo)類學(xué)實(shí)驗(yàn)室富勒進(jìn)化生物學(xué)計(jì)劃的新研究表明,從遺傳學(xué)角度來(lái)看,藍(lán)翅和金翅鶯幾乎完全相同。該研究背后的科學(xué)家表示,兩種物種之間的主要差異在于羽毛顏色和花紋,在某些情況下,這只是基因變體或等位基因的顯性或隱性配對(duì)的簡(jiǎn)單問(wèn)題。
研究報(bào)告的共同作者大衛(wèi)·托伊斯說(shuō):“我們認(rèn)為我們最終確定了這些分類群中眾所周知的基因組”大海撈針“,并補(bǔ)充說(shuō),保護(hù)主義者應(yīng)該更少關(guān)注雜交,主要集中在保護(hù)這兩個(gè)物種的棲息地。“這是保護(hù)從業(yè)者長(zhǎng)期以來(lái)所需要的。”
該研究發(fā)表在9月出版的“ 當(dāng)代生物學(xué) ”雜志上。Toews的合作者包括康奈爾大學(xué)實(shí)驗(yàn)室博士后研究員Scott Taylor,康奈爾大學(xué)生物統(tǒng)計(jì)與計(jì)算生物學(xué)系,加州大學(xué)河濱分校和環(huán)境與氣候變化加拿大合作伙伴。
該小組通過(guò)分析來(lái)自紐約的10只金翅鶯和10只藍(lán)翅鶯的基因組,調(diào)查了兩只鶯之間差異背后的遺傳結(jié)構(gòu),從新澤西州邊界的斯特林森林到圣勞倫斯河的采樣谷。在他們對(duì)兩個(gè)物種的整個(gè)基因組的分析中,他們發(fā)現(xiàn)只有六個(gè)區(qū)域(或小于.03%)顯示出強(qiáng)烈的差異。換句話說(shuō),藍(lán)翅和金翅鶯的遺傳基因相同,為99.97%。
其中一個(gè)分化區(qū)域有一個(gè)可能控制黃色/白色與黑色喉部著色的基因; 金翅鶯的黑色喉嚨是Mendellian隱性特征,僅發(fā)生在具有這種遺傳變異的一對(duì)隱性等位基因的鳥(niǎo)類中。另一個(gè)地區(qū)可能控制體色; 藍(lán)翅鶯的黃體可能是一種不完全隱性的特征。
當(dāng)藍(lán)翅和金翅鶯雜交時(shí),它們會(huì)產(chǎn)生各種雜交種,包括兩種形式,稱為布魯斯特鶯(有一個(gè)輕體,沒(méi)有黑色喉嚨)和勞倫斯鶯(有一個(gè)黃色的身體和黑色的喉嚨)。新的研究表明,布魯斯特的金色和藍(lán)翅鶯雜種的形式似乎是喉嚨和體色的主要特征的表達(dá),而勞倫斯的混合形式表現(xiàn)出兩者的隱性特征表達(dá)。
這項(xiàng)研究支持1908年美國(guó)自然歷史博物館的John T. Nichols提出的一個(gè)模型,即布魯斯特的金色和藍(lán)翅鶯混合體的形式是主要特征的表達(dá),勞倫斯的形式是隱性的 - 特質(zhì)表達(dá)。換句話說(shuō),金色和藍(lán)色翅膀鶯之間驚人的視覺(jué)差異可以被認(rèn)為類似于有雀斑和沒(méi)有雀斑的人之間的差異。
該研究還表明,金翅膀和藍(lán)翅的遺傳分化甚至比Swainson的鵝口瘡的兩個(gè)亞種更少,橄欖支撐和赤褐色支持形式。
Toews,Taylor和他們的合作者還分析了來(lái)自其范圍內(nèi)的金翅和藍(lán)翅鶯的遺傳區(qū)域的子集,并發(fā)現(xiàn)遠(yuǎn)離曼尼托巴和密蘇里的個(gè)體顯示出類似的基因組差異。這種遺傳數(shù)據(jù)不僅包含了今天鳥(niǎo)類的不同信息,還包含過(guò)去它們可能分離多久或雜交的信息。
回到250年前,金翅和藍(lán)翅鶯首先被科學(xué)描述,他們被認(rèn)為生活在不同的地方,在東北部和中西部的上部有金色翅膀,在距離中部稍遠(yuǎn)的一個(gè)帶的藍(lán)色翅膀中。奧沙克到阿巴拉契亞山脈。并且有人認(rèn)為,從1700年代末開(kāi)始,歐洲定居者的森林砍伐造成了棲息地的變化,使兩種物種聚集在一起,引起了它們的雜交。
在使用整個(gè)基因組深入研究這些鳥(niǎo)類的進(jìn)化歷史時(shí),泰勒和托伊斯發(fā)現(xiàn)了一個(gè)令人驚訝的發(fā)現(xiàn):這兩個(gè)物種可能已經(jīng)混合了數(shù)千年,至少是間歇性的,遠(yuǎn)在歐洲人殖民北美之前。
“這種雜交被認(rèn)為是我們[人類]的錯(cuò)誤,”泰勒說(shuō)。“但這兩種物種雜交的傾向是自然的,似乎是歐洲前歐洲進(jìn)化史的一部分。”
雜交是2012年由保護(hù)團(tuán)體和政府機(jī)構(gòu)聯(lián)合出版的國(guó)家金翅鶯保護(hù)計(jì)劃中發(fā)現(xiàn)的威脅之一,盡管年輕森林棲息地的喪失被認(rèn)為是主要威脅。雜交和人類因果關(guān)系問(wèn)題可能在美國(guó)魚類和野生動(dòng)物管理局即將出臺(tái)的關(guān)于金翅鶯是否需要根據(jù)瀕危物種法案進(jìn)行聯(lián)邦保護(hù)的決定中發(fā)揮作用。
金翼/藍(lán)翼遺傳相似性的問(wèn)題可能對(duì)美國(guó)鳥(niǎo)類學(xué)家聯(lián)盟提出了一個(gè)棘手的問(wèn)題,如果它的北美分類委員會(huì)被要求在一個(gè)暗金翅膀和藍(lán)翼的提議中考慮這個(gè)證據(jù)成一個(gè)物種。
泰勒說(shuō):“有人肯定可以說(shuō)金翅鶯和藍(lán)翅鶯是一種多態(tài)物種。它們非常相似。” “從保護(hù)的角度來(lái)看,它們需要相似類型的年輕森林棲息地,所以我們可以類似地對(duì)待它們,無(wú)論是以保護(hù)一個(gè)物種的名義還是兩個(gè)密切相關(guān)的物種的復(fù)合體。”
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