計(jì)算機(jī)模型將基因位點(diǎn)轉(zhuǎn)變?yōu)榧膊C(jī)制

雖然全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)已被證明在揭示與疾病相關(guān)的基因位點(diǎn)方面具有無可估量的價(jià)值，但確定這些基因座內(nèi)確切的致病變體以及變體如何引起疾病仍然是一項(xiàng)挑戰(zhàn)?，F(xiàn)在，來自德國，卡塔爾，美國和挪威的國際研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于計(jì)算機(jī)的模型，稱為系統(tǒng)發(fā)育模塊復(fù)雜性分析(PMCA)，用于跟蹤人類基因組中引起疾病??的遺傳變異。

研究人員利用PMCA確定了非編碼基因組區(qū)域的遺傳變異，這些變異結(jié)合了轉(zhuǎn)錄因子以調(diào)節(jié)基因表達(dá)，展示了它們?nèi)绾闻c疾病機(jī)制相關(guān)聯(lián)，并在Cell中發(fā)表了他們的研究結(jié)果。

為了測試PMCA，研究人員將其應(yīng)用于一組47個(gè)2型糖尿病(T2D)風(fēng)險(xiǎn)基因座，在計(jì)算機(jī)模擬研究中引起胰島素抵抗和胰島素分泌受損等并發(fā)癥。他們發(fā)現(xiàn)基因組中基因調(diào)控的變異導(dǎo)致DNA-蛋白結(jié)合增加3.1到101倍。

為了在實(shí)驗(yàn)上測試他們的發(fā)現(xiàn)，研究人員將人類脂肪基質(zhì)細(xì)胞中PPARG基因非編碼區(qū)的單堿基變異歸為一類。這種變異阻斷了PPARG2蛋白的活性，PPARG2蛋白在脂肪酸儲(chǔ)存中起作用，破壞葡萄糖代謝并引發(fā)T2D。

他們認(rèn)為PMCA可用于各種疾病，如癌癥，心肌梗塞和甲狀腺激素抵抗。該研究的共同作者M(jìn)elina Claussnitzer說：“這些結(jié)果為開發(fā)更好的診斷手段和針對各種遺傳疾病的定制療法提供了巨大的希望。”

鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。

推薦內(nèi)容