DNA的直接圖像顯示其測量結(jié)果
盡管DNA分子的雙螺旋已經(jīng)成為遺傳學家的標志,但大多數(shù)關(guān)于其結(jié)構(gòu)的知識都是基于間接測量的數(shù)字模擬圖像收集的。
現(xiàn)在,國王阿卜杜拉科技大學(KAUST)的Enzo Di Fabrizio團隊制作了一個單一DNA分子的高分辨率直接圖像。
2012年,當時在意大利理工學院的Di Fabrizio拍攝了DNA分子的第一個電子顯微鏡圖像。高能電子束的能量太大,破壞了單個DNA分子,將它們限制在幾個分子的成像束中?,F(xiàn)在在KAUST,Di Fabrizio和他的團隊開發(fā)了一種使用較低光束功率來拍攝DNA分子的方法。
通過將DNA懸浮在帶孔的基底中,它們避開了通常在基底上發(fā)生的電子散射。這增加了信噪比,減少了所需的電子劑量,使他們能夠以1.5?s的分辨率顯示單個DNA分子。
該團隊使用得到的圖像來測量DNA分子的特征,例如其直徑和螺旋的螺距。他們的測量結(jié)果與早期X射線顯微鏡實驗的結(jié)果相符。與傳統(tǒng)的X射線技術(shù)不同,傳統(tǒng)的X射線技術(shù)是對許多分子進行平均測量,新方法從單個分子中收集數(shù)據(jù),從而能夠檢測出生物學上重要的結(jié)構(gòu)變化。
從單個DNA分子進行精確測量的能力將有助于研究人員解決結(jié)構(gòu)生物學和分子醫(yī)學中的問題。
盡管最終的成像步驟是在真空中用干燥的DNA分子進行的,但是制備過程被設(shè)計成模擬生理條件。“這意味著在制備過程中,我們可以允許DNA與蛋白質(zhì)相互作用,例如,在生理條件下進行過程,”Di Fabrizio解釋說。
倫敦納米技術(shù)中心的納米級生物物理研究員Bart Hoogenboom用原子力顯微鏡對單個DNA分子進行成像,他說這項工作向前邁進了一步,但強調(diào)了在樣品制備過程中需要拉直DNA分子。
“在活細胞中,DNA不會以如此長的直線構(gòu)型出現(xiàn),而是呈現(xiàn)出更加盤繞和打結(jié)的結(jié)構(gòu)外觀,這對于如何促進和抑制基因表達非常重要,”他說。
盡管如此,高分辨率圖像揭示了未通過X衍射測量的重要結(jié)構(gòu)信息,例如單個堿基和骨架的長度或螺旋軸傾斜角度。
“在單個DNA分子水平上的知識將幫助我們理解與表觀遺傳修飾或蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)的問題,”Di Fabrizio說,并補充說新技術(shù)“也可能對其他科學領(lǐng)域產(chǎn)生影響,如分子電子學和納米制造用DNA作為支架。“
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