研究人員開發(fā)了數(shù)學模型質(zhì)疑對基因表達的長期假設
哈佛大學約翰·保爾森工程與應用科學學院(SEAS)的研究人員開發(fā)了一種數(shù)學模型,為細胞中基因表達的基本過程提供了新的視角。雖然自20世紀50年代以來已知基因表達 -DNA,mRNA,核糖體和聚合酶的主要參與者,但它們在細胞周期中如何相互作用仍不清楚。
在以前的模型中,研究人員認為轉錄率(制作DNA的mRNA拷貝)和翻譯(將mRNA轉化為氨基酸序列)受到細胞中DNA和mRNA數(shù)量的限制。但新模型與現(xiàn)有實驗數(shù)據(jù)相結合,實際上表明核糖體和聚合酶控制著細胞中蛋白質(zhì)和mRNA的水平。
“我們的研究表明,廣泛使用的基因表達模型和各種其他細胞過程必須以有趣的方式進行修訂,”SEAS應用數(shù)學助理教授,該論文的高級作者Ariel Amir說。該研究最近發(fā)表在Nature Communications上。
要了解細胞周期的工作原理,可以將細胞想象成一個需要不斷添加新表的流行餐廳。問題是:在廚房無法跟上之前可以添加多少張桌子?
所有餐廳的菜單都來自家庭食譜DNA。在這本食譜里面有許多食譜,即mRNA。這些食譜被Xerox機器,聚合酶機復制,并由廚師,核糖體烹飪。
在先前的基因表達模型中,餐館的增長受到烹飪書數(shù)量的限制,這限制了在任何時間點漂浮的食譜的數(shù)量。
在新的模式,但是,說餐廳的成長往往是由施樂機器復制配方的數(shù)量和在廚房里的廚師數(shù)量的限制。核糖體和聚合酶限制基因表達。
“由于基因表達是生物學的基礎,新模型可能對我們對其他細胞過程的理解產(chǎn)生影響,包括細胞周期調(diào)控,細胞形狀調(diào)節(jié)等,”SEAS應用數(shù)學喬治航空公司博士后研究員林杰說。該論文的第一作者。
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