活性染色質(zhì)標(biāo)記驅(qū)動秀麗隱桿線蟲細(xì)胞核中異染色質(zhì)的空間隔離
基因表達(dá)的發(fā)育程序的執(zhí)行需要將基因組準(zhǔn)確地分配到亞核區(qū)室中,其中活性常染色質(zhì)富集中央和沉默的異染色質(zhì)在核周邊1。鏈接到拉明甲突變退行性疾病的存在表明,核周染色質(zhì)的結(jié)合有助于細(xì)胞型完整性2,3。
組蛋白H3(H3K9me)的賴氨酸9的甲基化表征異染色質(zhì)并介導(dǎo)內(nèi)核膜4處的轉(zhuǎn)錄抑制和染色質(zhì)錨定。在秀麗隱桿線蟲胚胎中,與內(nèi)核膜結(jié)合的染色體結(jié)構(gòu)域蛋白CEC-4通過H3K9me連接異染色質(zhì)3,5,而在分化的組織,一個(gè)第二異-截存途徑被誘導(dǎo)。
在這里,我們使用cec-4背景中的RNA干擾篩選,并將MRG-1鑒定為廣泛表達(dá)的因子,這是腸細(xì)胞中第二染色質(zhì)錨定所必需的。然而,MRG-1僅與常染色質(zhì)結(jié)合,表明它間接起作用。雙mrg-1中的異染色質(zhì)脫離;通過耗盡組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶CBP-1 / p300或轉(zhuǎn)錄因子ATF-8(bZIP家族的成員(已知其募集CBP / p300))來拯救cec-4突變體。
CB-1在cec-4中的過表達(dá)突變體足以使異染色質(zhì)以ATF-8依賴性方式離域。在mrg-1敲低后,異染色質(zhì)中CBP-1和H3K27ac水平增加,與離域一致。
這表明秀麗隱桿線蟲中染色質(zhì)的空間組織受到沉默染色質(zhì)的直接核周附著以及常染色質(zhì)中CBP-1 / p300的活性保留的調(diào)節(jié)。這兩種途徑在胚胎和幼蟲組織中有差異,MRG-1的CBP-1隔離在分化細(xì)胞中起主要作用。
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