科學(xué)家開發(fā)出新的分析方法來解碼基因組的功能元件

有機(jī)體生命中最深刻的變化之一就是安東尼奧·吉拉德斯所說的“胚胎青春期”：早期胚胎停止接受母親指示如何開發(fā)和激活自己的基因組以取代這些指令的階段。這個(gè)關(guān)鍵階段，稱為母系到合子的轉(zhuǎn)變，發(fā)生在從?？饺祟惖乃信咛ブ?。然而，它在胚胎中的調(diào)控方式還不得而知。

本周在自然方法中，Giraldez及其同事提出了一種新方法來破譯胚胎用來指導(dǎo)許多母體信息(mRNA)被破壞的遺傳密碼，而其他信息則被破壞。Giraldez是耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教授，并且是MBL惠特曼中心的2016年研究獎(jiǎng)獲得者，他在那里進(jìn)行了部分研究。

Giraldez說，這種名為RESA(RNA元素選擇分析)的方法具有廣泛的應(yīng)用。“這是一種模塊化的方法，我們可以在許多情況下使用，取決于研究者想要問的問題，剖析基因組不同部分的含義。它是一個(gè)分子'Rosetta石'，幫助我們解碼其中的功能元素基因組“。

在這種情況下，他們使用RESA來檢測(cè)斑馬魚胚胎中數(shù)百萬個(gè)RNA片段的穩(wěn)定性或衰變，這反過來又提供了關(guān)于在母體到合子過渡期間關(guān)閉或激活的基因的信息。

Giraldez說，該團(tuán)隊(duì)在斑馬魚中開發(fā)了RESA，“但目標(biāo)是將其用于許多不同的物種，因此我們可以在基因組中找到有意義的'單詞'或指令，從魷魚到小鼠再到人類。” 他計(jì)劃明年繼續(xù)在MBL的魷魚和其他海洋模型系統(tǒng)中測(cè)試RESA，例如海膽和櫛水母。

“這是我最興奮的部分，MBL為我們提供了在多個(gè)物種中測(cè)試RESA的機(jī)會(huì)，”Giraldez說。“這是無價(jià)之寶;它的作品在世界其他任何地方都無法完成。”

“MBL讓我意識(shí)到我們對(duì)一些物種知之甚多，而對(duì)其他物種知之甚少，”Giraldez說。“但是現(xiàn)在，通過像RESA這樣的新測(cè)序技術(shù)，我們可以更全面地了解各種物種的生物學(xué)。這真的是一場(chǎng)新的革命。”

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