研究人員區(qū)分促進癌癥生長的突變和不促進癌癥生長的突變
到目前為止,研究人員認為癌癥腫瘤中的復發(fā)突變(熱點突變)是促進癌癥進展的重要突變(驅(qū)動突變)。加利福尼亞大學歐文分校領導的一項新研究表明,這并非總是如此。
鑒定對癌癥進展重要的驅(qū)動基因的方法依賴于患者的復發(fā)金標準。看到完全相同的DNA堿基對在許多患者中反復突變已被認為是無可辯駁的證據(jù),證明突變必須有助于腫瘤的發(fā)展。然而,今天發(fā)表在“ 科學 ”雜志上的這項研究“由APOBEC3A和中尺度基因組特征驅(qū)動的癌癥中的乘客熱點突變” 揭示了許多復發(fā)的癌癥突變可能是乘客熱點突變,對癌癥發(fā)展并不重要。
“在我們的研究中,我們發(fā)現(xiàn)在DNA莖環(huán)中發(fā)現(xiàn)的某些復發(fā)突變,一種常見的DNA結(jié)構(gòu),實際上是乘客熱點,而不是我們原先認為它們的驅(qū)動因素。” RémiBuisson博士說,他是UCI醫(yī)學院生物化學系的助理教授,也是該研究的首席研究員。更重要的是,我們發(fā)現(xiàn)在莖環(huán)外的DNA位置發(fā)現(xiàn)的其他復發(fā)突變可能是尚未表征的新驅(qū)動因子。我們發(fā)現(xiàn)的重要性在于它使我們能夠區(qū)分突變,這對于開發(fā)新的癌癥療法至關重要。“
來自UCI醫(yī)學院和麻省總醫(yī)院的研究小組檢查了超過9,000例患者腫瘤的癌癥基因組中的突變情況和突變分布。他們發(fā)現(xiàn)某些熱點突變來自稱為APOBEC的蛋白質(zhì)家族(載脂蛋白B mRNA編輯催化多肽樣)的活性。
“我們的分析顯示APOBEC3A特別強烈偏愛稱為莖環(huán)或DNA發(fā)夾的DNA結(jié)構(gòu)。這種偏好會導致患者腫瘤中出現(xiàn)熱點突變,”Buisson說。
每天在人體細胞中發(fā)生數(shù)萬次DNA損傷事件。APOBEC蛋白家族是癌細胞中最常見的內(nèi)源性DNA損傷事件來源之一。APOBEC3A直接攻擊基因組DNA,誘導DNA雙鏈斷裂和突變。到目前為止,人們對APOBEC3A如何靶向基因組DNA知之甚少,以及基因組的某些結(jié)構(gòu)是否比其他基因組更容易發(fā)生APOBEC3A攻擊。DNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)可以在DNA復制,轉(zhuǎn)錄過程中或通過不同的DNA修復過程瞬時產(chǎn)生。這些多種途徑為APOBEC3A促進結(jié)構(gòu)特異性胞嘧啶脫氨作用提供了許多機會,有利于患者腫瘤中的乘客熱點突變的出現(xiàn)。
這項研究得到了美國國立衛(wèi)生研究院,國立衛(wèi)生研究院獨立獎學金和馬薩諸塞州綜合醫(yī)院癌癥研究中心的資助。
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