在全球范圍內(nèi)，生物多樣性集中在赤道附近，但是生成DNA序列數(shù)據(jù)的科學(xué)機(jī)構(gòu)研究生物多樣性往往聚集在發(fā)達(dá)國(guó)家的兩極。然而，DNA測(cè)序成本的迅速下降有可能改變這種動(dòng)態(tài)，并創(chuàng)造更公平的基因研究全球分布。在最近一期“植物科學(xué)應(yīng)用”中發(fā)表的研究中，Gillian Dean博士及其同事展示了在印度尼西亞實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)高質(zhì)量序列數(shù)據(jù)的可行性。

對(duì)于發(fā)展中國(guó)家的許多實(shí)驗(yàn)室而言，缺乏資金和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)是產(chǎn)生其自身DNA序列數(shù)據(jù)的主要障礙。然而，近年來(lái)，生產(chǎn)DNA序列數(shù)據(jù)的財(cái)務(wù)，技術(shù)和后勤負(fù)擔(dān)急劇下降。DNA測(cè)序越來(lái)越多地集中在“核心”設(shè)施上，專(zhuān)門(mén)用于以高容量和低成本從制備的樣品中生產(chǎn)高質(zhì)量的序列數(shù)據(jù)。這意味著實(shí)驗(yàn)室只需要對(duì)組織進(jìn)行初步處理，以準(zhǔn)備將DNA樣本送至測(cè)序核心設(shè)施。

制備樣品用于測(cè)序所必需的分子技術(shù)如DNA提取，純化和PCR現(xiàn)在已經(jīng)非常成熟，使用相當(dāng)便宜的試劑(成分)相對(duì)簡(jiǎn)單的方案。“建立一個(gè)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室似乎令人生畏，但隨著方法變得越來(lái)越便宜和越來(lái)越強(qiáng)大，它確實(shí)可以讓越來(lái)越多的研究人員接觸到，”該研究的第一作者Gillian Dean博士解釋道。“我們希望分享我們的專(zhuān)業(yè)知識(shí)，以幫助人們?cè)O(shè)置這些方法，并充分利用可生成的數(shù)據(jù)類(lèi)型。”因此，Dean博士及其同事在西爪哇省Cibinong的印度尼西亞科學(xué)研究中心生物學(xué)研究中心植物標(biāo)本館的分子系統(tǒng)學(xué)實(shí)驗(yàn)室比較了生成DNA序列數(shù)據(jù)的方法。印度尼西亞。該試點(diǎn)研究中產(chǎn)生的DNA條形碼數(shù)據(jù)是印度尼西亞西加里曼丹省Gunung Palung國(guó)家公園開(kāi)放式數(shù)字植物群的項(xiàng)目的一部分。

幫助發(fā)展中國(guó)家的實(shí)驗(yàn)室建立生產(chǎn)DNA序列數(shù)據(jù)的能力，擴(kuò)大了DNA序列數(shù)據(jù)庫(kù)的貢獻(xiàn)者數(shù)量，這對(duì)科學(xué)普遍有益，可能有助于任何數(shù)量的生物信息學(xué)分析。據(jù)迪恩博士說(shuō)，“更廣泛的科學(xué)界通過(guò)提高人們產(chǎn)生數(shù)據(jù)的能力而受益。”但它也加強(qiáng)了發(fā)展中國(guó)家的科學(xué)機(jī)構(gòu)，擴(kuò)大了科學(xué)家可以進(jìn)行的研究和他們可以回答的問(wèn)題。

“準(zhǔn)備感興趣的DNA用于測(cè)序的能力意味著發(fā)展中國(guó)家的科學(xué)家在設(shè)計(jì)項(xiàng)目，選擇他們產(chǎn)生的數(shù)據(jù)以及出于何種目的時(shí)擁有更多的自主權(quán)，”Dean博士解釋說(shuō)。“它還使這些科學(xué)家能夠平等地訪(fǎng)問(wèn)和控制結(jié)果數(shù)據(jù)。”除了科學(xué)效益之外，還有一個(gè)法律理由可以擴(kuò)大向更多國(guó)家生成DNA序列數(shù)據(jù)的能力，因?yàn)樵S多生物多樣性的國(guó)家已經(jīng)制定了限制在境外進(jìn)行的研究獲取抽樣的法律。

Dean博士還強(qiáng)調(diào)了擴(kuò)大發(fā)展中國(guó)家分子實(shí)驗(yàn)室能力的倫理方面，這有助于建立一個(gè)更公平的全球科學(xué)機(jī)構(gòu)，并解決殖民主義的遺產(chǎn)問(wèn)題。“我認(rèn)為重點(diǎn)是我們必須更多地包括來(lái)自樣本來(lái)源國(guó)家的科學(xué)家。從歷史上看，來(lái)自較發(fā)達(dá)國(guó)家的研究人員已經(jīng)到達(dá)并將標(biāo)本帶回他們的祖國(guó)，并且在許多情況下還沒(méi)有分享結(jié)果數(shù)據(jù)與原籍國(guó)，“迪恩博士說(shuō)。“我們必須擺脫這種局面，開(kāi)始在欠發(fā)達(dá)國(guó)家開(kāi)展公平的研究。”這項(xiàng)研究代表了漫長(zhǎng)旅程的一步。