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      研究蛋白質RNA網(wǎng)絡的新方法
      
			
      
				2019-02-25 09:53:04
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      對于他們的重要任務，所有RNA分子都需要蛋白質作為結合伴侶。德國癌癥研究中心(Deutsches Krebsforschungszentrum，DKFZ)的科學家和歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的同事開發(fā)出了第一種分析細胞整個RNA蛋白網(wǎng)絡組成的方法。這種新方法現(xiàn)已發(fā)表在科學期刊Cell上。
      

      研究蛋白質RNA網(wǎng)絡的新方法
      

      RNA分子在每個細胞中執(zhí)行重要任務，信使RNA(mRNA)有助于將存儲在DNA中的遺傳信息轉化為蛋白質。然而，存在許多其他未翻譯成蛋白質的 RNA分子。事實上，人類細胞中只有5%的RNA是mRNA。
      

      對于它們的許多功能，RNA分子必須與蛋白質相互作用。有時，不同類型的RNA與特定蛋白質結合形成高度復雜的分子機器，最好的例子是發(fā)生蛋白質合成的核糖體。
      

      “我們每個細胞都有一個巨大的相互作用的RNA和蛋白質網(wǎng)絡，但我們對這個網(wǎng)絡的確切成分知之甚少。我們想了解哪些蛋白質與RNA結合，以及細胞類型之間的差異，或者在細胞受到壓力的情況下，我們現(xiàn)在開發(fā)了一種方法，使我們能夠第一次對此進行研究，“來自DKFZ的Jeroen Krijgsveld說。
      

      到目前為止，這種分析只能針對一類RNA進行，即mRNA。mRNA是指導蛋白質序列的模板。使用現(xiàn)有方法無法檢測蛋白質與所有其他所謂的非編碼RNA類型的相互作用，其中一些僅僅已知數(shù)年。“非編碼RNA遠遠超過mRNA分子，它們滿足各種監(jiān)管目的”Krijgsveld解釋說。
      

      與EMBL的同事一起，Krijgsveld現(xiàn)已成功開發(fā)出一種稱為XRNAX的方法，用于分析所有RNA類與細胞蛋白的相互作用。使用XRNAX，科學家們也可以做出定量陳述：他們不僅可以看到什么蛋白質結合RNA，還能看到什么程度。通過這種方式，他們能夠觀察到當細胞暴露于毒素時RNA結合如何發(fā)生變化。此外，通過這種新方法，研究小組發(fā)現(xiàn)了數(shù)百種以前不知道與RNA結合的蛋白質。
      

      “使用XRNAX，我們能夠測量蛋白質和RNA之間的所有相互作用，這是以前沒人能測量的。” 解釋了開發(fā)XRNAX的Jakob Trendel。“許多蛋白質 - RNA相互作用被懷疑是導致疾病的根本原因，包括癌癥，肌萎縮側索硬化癥或HIV等病毒感染?，F(xiàn)在我們有辦法看待它們。”
      
			

			
        
      
			
      
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