細菌有助于發(fā)現(xiàn)人類致癌蛋白
由貝勒醫(yī)學(xué)院和德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的研究小組采用了一種非常規(guī)方法,利用細菌發(fā)現(xiàn)可導(dǎo)致DNA損傷和促進癌癥的人類蛋白質(zhì)。該報告在Cell雜志上報道,該研究還提出了這些蛋白質(zhì)可能對DNA造成損害的生物學(xué)機制,為未來的癌癥治療開辟了可能性。
“我們的細胞會產(chǎn)生蛋白質(zhì)致癌物質(zhì),”共同通訊作者Susan M. Rosenberg博士,Ben F. Love癌癥研究主席,分子與人類遺傳學(xué)教授,分子病毒學(xué)和微生物學(xué)以及貝勒的生物化學(xué)和分子生物學(xué)雜志說。“癌癥是一種突變疾病。在特定基因中積累了幾個突變的正常細胞很可能變成癌細胞。”
導(dǎo)致癌癥的突變可能是DNA損傷的結(jié)果。煙草煙霧和陽光等外部因素可以破壞DNA,但大多數(shù)DNA損傷似乎是由細胞內(nèi)發(fā)生的事件引起的,并且是由細胞成分(包括蛋白質(zhì))介導(dǎo)的。盡管這些事件很重要,但尚未對它們進行廣泛研究。
“蛋白質(zhì)可以導(dǎo)致DNA損傷的一種方式是過度生產(chǎn),這是一種相對頻繁的細胞事件,”羅森伯格說,他也是貝勒Dan L Duncan綜合癌癥中心癌癥進化計劃的負責人。“在這項研究中,我們開始發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì),當細胞過量產(chǎn)生時,會以導(dǎo)致癌癥的方式對DNA造成損害。”
為了揭示這些DNA“損傷”蛋白質(zhì),研究人員采用了一種非傳統(tǒng)的方法。他們通過觀察蛋白質(zhì)來搜索促進人體細胞DNA損傷的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)在過量產(chǎn)生時會在細菌大腸桿菌中引起DNA損傷。
“盡管細菌和人類不同,但它們的基本生物學(xué)過程是相似的,因此我們認為通過這種方法我們可能會找到可能與癌癥相關(guān)的DNA損傷的常見機制,”羅森伯格說。
“這是一個瘋狂的想法,”羅森伯格說,并且可能是因為兩個來源的資金旨在嘗試高風險策略,如果成功,將產(chǎn)生很大影響:國立衛(wèi)生研究院院長的先鋒獎和來自WM Keck基金會,以及16個實驗室團隊的許多其他資助。
大腸桿菌揭示了癌癥促進蛋白的新候選物
研究人員對細菌進行了基因改造,以便在DNA被破壞時發(fā)出紅色熒光。然后,他們單獨過表達大腸桿菌中存在的4,000個基因中的每一個,并確定哪些基因使細菌發(fā)紅。
“我們發(fā)現(xiàn)了一個廣泛而多樣的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò),當它們過量生產(chǎn)時,會以導(dǎo)致DNA損傷的方式改變細胞,”羅森伯格說。“正如預(yù)期的那樣,這些蛋白質(zhì)中的一些參與DNA加工或修復(fù),但令人驚訝的是,大多數(shù)蛋白質(zhì)與DNA沒有直接關(guān)系。例如,一些DNA損傷蛋白參與分子在細胞膜上的轉(zhuǎn)運。 “。
當研究人員尋找他們在細菌中發(fā)現(xiàn)的DNA“損傷”蛋白質(zhì)的人類蛋白質(zhì)親屬時,他們發(fā)現(xiàn)了284.有趣的是,他們確定這些人類蛋白質(zhì)與癌癥的隨機蛋白質(zhì)相關(guān)。此外,蛋白質(zhì)的RNA(蛋白質(zhì)產(chǎn)生的指標)預(yù)測了腫瘤的誘變和患者預(yù)后不良。當研究人員在實驗室中過量產(chǎn)生人體細胞中的這些蛋白質(zhì)時,一半的蛋白質(zhì)會引發(fā)DNA損傷和突變。
“我們發(fā)現(xiàn)大腸桿菌可以幫助快速,低成本地鑒定DNA損傷蛋白質(zhì)和人體細胞中的作用機制。已知一些蛋白質(zhì)及其機制與癌癥有關(guān),但許多其他蛋白質(zhì)并未被懷疑存在。在致癌名單中,“貝勒醫(yī)學(xué)院分子與人類遺傳學(xué),分子病毒學(xué)和微生物學(xué)教授,Dan L Duncan綜合癌癥中心成員Christophe Herman博士說。
“我認為識別DNA可以被破壞的方式是非常了不起的。這項研究為開發(fā)保護我們基因組的新機制以及它們的功能障礙如何改變我們DNA的完整性并導(dǎo)致癌癥開辟了新的途徑,”co說。 - 相應(yīng)的作者Kyle M. Miller博士,德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校生物科學(xué)副教授,Baylor的Dan L Duncan綜合癌癥中心成員。“這是模型生物發(fā)現(xiàn)能夠揭示人類細胞和癌癥如何發(fā)揮作用的基本生物過程的力量的另一個例子。”
“我們的工作對基礎(chǔ)生物學(xué)領(lǐng)域和臨床研究都有重要意義,”羅森伯格說。“我們對可能導(dǎo)致癌癥的DNA損傷的各種機制提供了一個以前未知的理解。在未來,這一發(fā)現(xiàn)可能會導(dǎo)致新的方法來識別可能患癌癥的人,以便制定預(yù)防癌癥的策略,減慢它的速度或者早點抓住它。“
該研究的兩位共同作者是獲得博士學(xué)位的學(xué)生:Baylor醫(yī)學(xué)院的Jun Xia博士和德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校的Liya Chiu博士。
有關(guān)所有貢獻者及其隸屬關(guān)系的完整列表以及本研究的財務(wù)支持,請訪問Cell雜志。
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