植物是如何像人腦一樣生長的
植物和大腦的相似之處超乎你的想象:索爾克的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),控制植物生長的數(shù)學(xué)規(guī)則與大腦細(xì)胞如何萌發(fā)連接的規(guī)則相似。這項(xiàng)新研究發(fā)表在2017年7月6日的《當(dāng)代生物學(xué)》(Current Biology)雜志上,基于植物的3D激光掃描數(shù)據(jù),研究表明,在許多生物系統(tǒng)中,分支生長可能存在普遍的邏輯規(guī)則。
索爾克整合生物學(xué)中心助理教授、論文的高級作者Saket Navlakha說:“我們的項(xiàng)目的動(dòng)機(jī)是,盡管我們在植物形態(tài)中看到了各種各樣的物種,但它們是否都有某種共同的形態(tài)或結(jié)構(gòu)。”“我們發(fā)現(xiàn),樹枝在空間中分布的變化可以用一種叫做高斯函數(shù)的數(shù)學(xué)方法來描述,這種函數(shù)也被稱為鐘形曲線。”
由于不能移動(dòng),植物必須找到創(chuàng)造性的策略來調(diào)整它們的建筑以應(yīng)對環(huán)境挑戰(zhàn),比如被鄰居遮擋。從高聳的紅杉到蔓生的百里香,植物形態(tài)的多樣性是這些策略的一個(gè)明顯標(biāo)志,但Navlakha想知道是否有某種看不見的組織原則在起作用。為了找到答案,他的團(tuán)隊(duì)使用了高精度的3D掃描技術(shù)來測量植物幼苗隨時(shí)間推移的結(jié)構(gòu),并以數(shù)學(xué)分析的方式量化它們的生長。
”這種合作源于Saket談話,我有他抵達(dá)索爾克后不久,”教授說,植物分子和細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的主任Joanne Chory誰,是霍華德·h·和Maryam r·紐曼椅子在植物生物學(xué),也是霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究者和論文的合著者之一。“多虧了索爾克的創(chuàng)新基金項(xiàng)目和霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所,我們才得以資助我們的研究。”
研究小組從三種具有農(nóng)業(yè)價(jià)值的作物開始:高粱、西紅柿和煙草。研究人員在植物可能自然生長的條件下(蔭涼、環(huán)境光、強(qiáng)光、高溫和干旱),用種子培育植物。在一個(gè)月的時(shí)間里,第一作者Adam Conn每隔幾天就會掃描每一株植物,以數(shù)字方式捕捉其生長情況。康涅狄格州總共掃描了近600家工廠。
索爾克研究所助理康說:“我們基本上就像掃描一張紙一樣掃描這些植物。”“但在這種情況下,這項(xiàng)技術(shù)是3D的,它允許我們捕捉到一個(gè)完整的形態(tài)——植物如何在空間中生長和分布分支的完整架構(gòu)。”
每一種植物的數(shù)字表現(xiàn)形式被稱為點(diǎn)云,是一組可以計(jì)算分析的空間三維坐標(biāo)。利用這些新數(shù)據(jù),研究小組通過研究植物的枝密度函數(shù),建立了理論上可能的植物形狀的統(tǒng)計(jì)描述。枝密度函數(shù)描述了在植物周圍空間的任意一點(diǎn)找到一根枝的可能性。
該模型揭示了生長的三個(gè)性質(zhì):可分性、自相似性和高斯分支密度函數(shù)??煞中砸馕吨粋€(gè)空間方向的增長獨(dú)立于其他方向的增長。根據(jù)Navlakha的說法,這種特性意味著生長是非常簡單和模塊化的,這可能會讓植物更能適應(yīng)環(huán)境的變化。自相似性意味著所有的植物都具有相同的基本形狀,盡管有些植物可能在一個(gè)方向上被拉伸得更大一些,或者在另一個(gè)方向上被擠壓得更大一些。換句話說,植物在蔭涼下生長并不比在強(qiáng)光下生長使用不同的統(tǒng)計(jì)規(guī)則。最后,該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),無論植物種類或生長條件如何,分支密度數(shù)據(jù)都遵循在植物邊緣截?cái)嗟母咚狗植??;旧?,這表明植物中心附近的樹枝生長密度最大,而在較遠(yuǎn)的地方,樹枝的密度隨著鐘形曲線的變化而減小。
這些特性所顯示的進(jìn)化效率之高令人驚訝。盡管植物在不同的環(huán)境條件下進(jìn)化出不同的生長規(guī)則是低效的,但研究人員并沒有想到植物會如此高效,以至于只發(fā)展出一種單一的功能形式。他們在這項(xiàng)工作中發(fā)現(xiàn)的特性可能有助于研究人員評估轉(zhuǎn)基因作物的新策略。
這篇論文的作者之一、索爾克分子神經(jīng)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(Salk’s Molecular Neurobiology Laboratory)教授查爾斯史蒂文斯(Charles Stevens)此前的研究發(fā)現(xiàn),大腦神經(jīng)元也具有同樣的三種數(shù)學(xué)特性。“神經(jīng)元喬木和植物芽之間的相似性是相當(dāng)驚人的,這似乎有一個(gè)潛在的原因,”史蒂文斯說。“或許,它們都需要盡可能完全地覆蓋一個(gè)地區(qū),但要以一種非常稀疏的方式,這樣它們才不會相互干擾。”
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