一只名為Sandy Maliki的野生出生的純澳大利亞沙漠野狗在世界上最有趣的基因組競賽中名列第一。新南威爾士大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的桑迪DNA被解碼的提議是太平洋生物科學(xué)SMRT格蘭特的五個(gè)決賽入圍者之一 - 特別迷人的植物或動(dòng)物的完整基因組的邊緣測序。

公眾確定了勝利者，兩歲的桑迪獲得了41%的國際社會選票，緊隨其后的是一條Temple Pitviper蛇，一艘太陽能海底船，一只爆炸性的轟炸機(jī)甲蟲和一只粉紅色的鴿子。

新南威爾士大學(xué)生物技術(shù)與生物分子科學(xué)學(xué)院的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，比爾巴拉德教授說：“我們很高興我們讓桑迪的DNA序列獲得了公眾的想象。”

“Sandy是真正的科學(xué)禮物。作為一種罕見的，野生的純野狗，她提供了一個(gè)獨(dú)特的案例研究。純野狗介于野狼和家養(yǎng)犬之間，具有一系列非馴化特性。因此對桑迪的基因組進(jìn)行測序?qū)椭_定一些基因的氣質(zhì)和行為，這些基因是從野生動(dòng)物到完美寵物過渡的基礎(chǔ)。

“同樣，通過開發(fā)改進(jìn)的野狗純度測試，了解更多關(guān)于野狗遺傳學(xué)將有助于保護(hù)這些美妙的澳大利亞動(dòng)物，”巴拉德教授說。

2014年，桑迪和她的姐姐和兄弟被澳大利亞動(dòng)物愛好者Barry和Lyn Eggleton在Strzelecki Track附近的澳大利亞沙漠中發(fā)現(xiàn)為三周大的幼崽，從那時(shí)起他們就一直手工飼養(yǎng)它們。幼崽接近死亡，他們的父母無法找到。該野狗測序項(xiàng)目將率先試查爾斯達(dá)爾文1868年的理論，馴化過程可以分為兩個(gè)步驟：無意識選擇非故意人為影響的結(jié)果; 和人工選擇是人類繁殖所需特性的結(jié)果。

“這個(gè)項(xiàng)目將揭示狼和野狗(無意識選擇)和野狗和狗(人工選擇)之間的DNA變化，”巴拉德教授說。

年度國際PacBio競賽的一個(gè)主要目標(biāo)是，今年吸引了200多個(gè)參賽作品，旨在提高公眾對科學(xué)的認(rèn)識以及基因組研究如何使社會受益。Sandy的團(tuán)隊(duì)設(shè)立了DancingwithDingoes Facebook頁面，獲得了世界各地人們的支持，包括動(dòng)物保護(hù)主義者和狼，野狗和狗的粉絲。

巴拉德教授說：“我們還與新南威爾士大學(xué)的工作人員和學(xué)生們進(jìn)行了接觸，將兩只來自Bargo Dingo Sanctuary的純高山野狗帶到校園里，供大家見面。”

最先進(jìn)的PacBio技術(shù)允許DNA在含有數(shù)萬個(gè)堿基的長切片中進(jìn)行測序，而不是像現(xiàn)有技術(shù)那樣在幾百個(gè)堿基的較短切片中測序。這可以揭示基因組中影響基因表達(dá)的重要重排。測序?qū)⒃趤喞Ｄ谴髮W(xué)進(jìn)行，并由Computomics在德國進(jìn)行初步分析。

Sandy項(xiàng)目背后的澳大利亞團(tuán)隊(duì)還包括悉尼大學(xué)的Claire Wade教授，新南威爾士大學(xué)的Richard Melvin博士，葡萄園獸醫(yī)醫(yī)院的Robert Zammit博士和Garvan醫(yī)學(xué)研究所的Andre Minoche博士。

新南威爾士大學(xué)在基因組學(xué)研究方面享有盛譽(yù)，該大學(xué)的Ramaciotti基因組學(xué)中心的科學(xué)家們研究了各種其他重要的本土生物的基因組，包括考拉，塔斯馬尼亞惡魔，袋熊，鴨嘴獸，昆士蘭果蠅。和Wollemi Pine。

新南威爾士大學(xué)分子生物學(xué)家兼副校長(教育)教授梅林克羅斯利說：“我們?yōu)樾履贤柺看髮W(xué)對基因組學(xué)貢獻(xiàn)的歷史感到非常自豪，我們很高興桑迪的基因組現(xiàn)在將被列為贏得這項(xiàng)競賽的獎(jiǎng)項(xiàng)。”

“澳大利亞有許多有趣的動(dòng)物可以進(jìn)行測序，結(jié)果可以增強(qiáng)我們對進(jìn)化和生物學(xué)的理解，并有助于改善農(nóng)業(yè)和蟲害管理”。有關(guān)Sandy Maliki及其兄弟姐妹Eggie Warrigal和Didi Mirigung的更多信息，請參閱他們的Pure Dingo Facebook頁面。

Dingoes大約5000年前被引入澳大利亞。人們普遍認(rèn)為他們沒有被澳大利亞土著居民馴化。純野狗變得越來越稀少，因?yàn)楸镜貏?dòng)物與野狗和家犬雜交，并且被土地所有者作為害蟲。