重新思考病毒在珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中的作用
傳統(tǒng)觀點認(rèn)為,在病毒 - 細(xì)菌種群動態(tài)中,病毒經(jīng)常會殺死宿主細(xì)菌細(xì)胞 - 這個過程稱為裂解 - 特別是當(dāng)細(xì)菌濃度很高時。一種稱為溶原性的不同動態(tài),其中病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)休眠但不殺死它們,被認(rèn)為是一種相對罕見的現(xiàn)象,主要發(fā)生在低細(xì)菌濃度下。但是,由圣地亞哥州立大學(xué)病毒信息研究所的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一項新研究表明,傳統(tǒng)智慧認(rèn)為它錯了:溶原性可能比以前認(rèn)為的更為常見,甚至在宿主密集在生態(tài)系統(tǒng)中時更為普遍,這種情況經(jīng)常發(fā)生在環(huán)境受到壓力。這些發(fā)現(xiàn)可以使人們更好地了解退化的珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)以及如何保護(hù)它們。
藻類大量繁殖,真菌枯萎病和細(xì)菌感染只是微生物在生態(tài)系統(tǒng)中迅速增加密度的幾種方式。生態(tài)學(xué)家對病毒如何應(yīng)對此類事件非常感興趣。傳統(tǒng)上,大多數(shù)研究人員都認(rèn)為,當(dāng)微生物種群繁殖時,棲息在它們中的病毒開始在它們內(nèi)部復(fù)制 - 裂解階段 - 提升它們自己的數(shù)量但殺死它們的宿主。
“這表明當(dāng)宿主饑餓和稀缺時,溶原性為病毒提供了臨時避難所,”該研究報告的作者在最近的研究中寫道。
羅格斯大學(xué)的博士后學(xué)者,SDSU病毒學(xué)家Forest Rohwer實驗室的前研究生Ben Knowles先前的研究顛覆了傳統(tǒng)的病毒動力學(xué)理論,發(fā)現(xiàn)即使宿主細(xì)胞濃度越來越高,仍保持溶原性的病毒。在他們的生態(tài)系統(tǒng) SDSU的病毒信息研究所是該大學(xué)自我認(rèn)定的卓越領(lǐng)域之一,是研究在細(xì)菌內(nèi)復(fù)制的病毒的世界領(lǐng)導(dǎo)者之一,也稱為噬菌體。
“這些早期的研究結(jié)果從根本上顛覆了病毒 - 宿主互動的動態(tài),”諾爾斯說。
為了更好地了解病毒如何隨著宿主數(shù)量的減少而逐漸消失,Knowles及其同事對39種出版物進(jìn)行了薈萃分析,這些出版物追蹤了這種模式并發(fā)現(xiàn)了令人驚訝的結(jié)果:宿主細(xì)胞密度與是否存在相關(guān)性研究人員在“ 自然微生物學(xué) ”雜志上報告說,他們的病毒具有溶解性或溶原性。
諾爾斯說,這些結(jié)果應(yīng)該鼓勵微生物學(xué)家重新校準(zhǔn)包括病毒 -細(xì)菌相互作用的種群模型,例如那些常用于預(yù)測珊瑚礁等生態(tài)系統(tǒng)如何對藻類大量繁殖和細(xì)菌入侵等微生物過度生長做出反應(yīng)的敏感性。
不幸的是,將溶原性結(jié)合到這些模型中是困難的。Knowles解釋說,如果病毒不能以可預(yù)測的方式殺死宿主,那么動態(tài)很快就會變得混亂而難以衡量。進(jìn)一步的研究可能會準(zhǔn)確揭示病毒從休眠的貪婪者轉(zhuǎn)移到復(fù)制殺手的原因,但這樣做可能需要對單個細(xì)胞進(jìn)行基因組分析 - 這一過程目前對于大型項目來說過于昂貴。
諾爾斯說,在此之前,該研究的結(jié)果強(qiáng)調(diào)了我們對病毒知之甚少以及它們?nèi)绾芜m應(yīng)其生態(tài)位。
“我們長期以來一直認(rèn)為病毒是殺手,因為它更符合模型,”他說。“但病毒與其主機(jī)交互的方式要復(fù)雜得多。”
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