葫蘆基因組提供了關(guān)于進(jìn)化歷史

Boyce Thompson研究所(BTI)，美國農(nóng)業(yè)部(USDA)的研究人員以及中國和法國的合作者已經(jīng)為葫蘆(Lagenaria siceraria)和最重建的基因組產(chǎn)生了第一個(gè)高質(zhì)量的基因組序列。最近的葫蘆科祖先。根據(jù)協(xié)議(58-0210-3-012)，美國國際開發(fā)署作為未來飼料計(jì)劃的一部分，并在美國農(nóng)業(yè)部國家糧食和農(nóng)業(yè)特殊作物研究計(jì)劃(2015-51181)的資助下支持該研究。 -24285)。葫蘆也被稱為葫蘆，因其在食品，醫(yī)藥和新奇產(chǎn)品(如樂器，器具，容器和裝飾品)中的眾多實(shí)用和文化上的重要用途而受到重視。作為其他葫蘆科作物的砧木，葫蘆也可作為基因組研究興趣的目標(biāo)。盡管如此，仍然沒有高質(zhì)量的葫蘆基因組序列，現(xiàn)代葫蘆科的許多進(jìn)化歷史及其遺傳關(guān)系仍然很大程度上未知。

在他們的研究結(jié)果中，研究人員將測序的葫蘆基因組與其他葫蘆科植物的基因組進(jìn)行了比較，使它們能夠重建葫蘆科的古老基因組歷史。“利用這個(gè)基因組和葫蘆科物種的其他可用基因組，包括西瓜，甜瓜，黃瓜和南瓜，我們重建了最近的葫蘆科共同祖先的基因組，它提供了對葫蘆科基因組進(jìn)化的古歷史的見解，”張軍飛說。，BTI副教授。

優(yōu)質(zhì)的葫蘆基因組序列還提供了葫蘆和其他葫蘆科植物之間遺傳關(guān)系的全面收集，可用于加速葫蘆品質(zhì)的改善和對疾病和感冒等壓力因素的耐受性。“這項(xiàng)研究將使研究人員能夠發(fā)現(xiàn)新的基因并開發(fā)出新的分子標(biāo)記，可以用來培育更高的水果品質(zhì)和更多的抗病葫蘆品種，”費(fèi)說。

研究人員能夠通過定位與一種特別具有破壞性的疾病相關(guān)的基因來展示基因組序列的實(shí)用性：木瓜環(huán)斑病毒(PRSV)。

美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局(USDA-ARS)研究植物病理學(xué)家Kai-Shu Ling表示：“高質(zhì)量的瓶子基因組幫助繪制了對PRSV產(chǎn)生抗性的基因座，PRSV是世界范圍內(nèi)感染木瓜和葫蘆的最具破壞性的病毒之一。” 。“ 基因組序列無疑將有助于在葫蘆中發(fā)現(xiàn)其他抗病基因和許多其他有益的特性，”Ling說。

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