研究人員確定了區(qū)分哺乳動(dòng)物和其他動(dòng)物的基因
哺乳動(dòng)物與其他脊椎動(dòng)物的區(qū)別是什么?來自德爾瑪醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究所(IMIM)的研究人員一直試圖與Universitat Pompeu Fabra(UPF)的研究人員合作回答這個(gè)問題。為此,他們分析了68種哺乳動(dòng)物的測序基因組,并鑒定了僅在這些動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)的6,000個(gè)基因家族。這些基因在哺乳動(dòng)物之外沒有同源物。在人類中,估計(jì)它們代表了編碼蛋白質(zhì)的基因的2.5%。該研究發(fā)表在“ 基因組生物學(xué)與進(jìn)化 ”雜志上。
Villanueva-Cañas博士說,這項(xiàng)工作的目的是“了解哪些基因?qū)⒉溉閯?dòng)物定義為一類。換句話說,哪些基因僅在這一組中發(fā)現(xiàn)。” 他設(shè)計(jì)了一套程序,可以比較68種哺乳動(dòng)物的基因組。這些包括智人和其他靈長類動(dòng)物,以及其他哺乳動(dòng)物,包括伊比利亞ly .. 根據(jù)這些數(shù)據(jù),他生成了大約6,000個(gè)哺乳動(dòng)物專有基因家族的目錄。與此同時(shí),他根據(jù)他們所在的物種為他們指定了可能的起源年齡。他還嘗試使用來自不同組織的表達(dá)數(shù)據(jù)(RNA測序),查看它們在何處以及如何表達(dá)以及檢查它們是否產(chǎn)生蛋白質(zhì)的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)來弄清楚這些基因的作用。
這些基因中的一些具有從頭起源,并非來自預(yù)先存在的基因的重復(fù)。從頭發(fā)基因?qū)τ谠谶M(jìn)化過程中獲得新功能非常重要,正如Albà博士領(lǐng)導(dǎo)的另一項(xiàng)研究所證明的那樣(“ 人類和黑猩猩中的de novo基因的起源 ”,發(fā)表于Plos Genetics)。這項(xiàng)新研究確定了其中一些基因的功能,這些基因與皮膚的結(jié)構(gòu)有關(guān),以及為什么它與例如爬行動(dòng)物以及哺乳動(dòng)物乳腺特征中涉及的其他基因不同。他們還發(fā)現(xiàn)了抗菌肽,它們參與機(jī)體對(duì)病原體的防御。
研究人員說,他們發(fā)現(xiàn)的基因很短,通常只有少數(shù)組織。Albà博士說:“這樣的研究有助于我們了解新基因在進(jìn)化過程中是如何形成的,以及它們是否在生物體適應(yīng)環(huán)境中發(fā)揮重要作用。編目哺乳動(dòng)物基因是了解它們功能的第一步。它讓我們更接近定義一組起源于其演變開始的部分,這些部分對(duì)于所有部分或其某些子組是共同的。“
Villanueva-Cañas博士說:“我們?nèi)匀徊恢阑虻闹匾糠值墓δ?,因此有必要努力表征它們?rdquo; 這是在研究期間發(fā)現(xiàn)的一種情況(神經(jīng)抑制素),其在大腦發(fā)育中起著迄今未知的作用。
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