機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)開(kāi)辟了一種尋找未知病毒的新方法。在發(fā)表在病毒進(jìn)化雜志上的研究中，牛津大學(xué)動(dòng)物學(xué)系的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)，新一代測(cè)序及其相關(guān)的在線DNA數(shù)據(jù)庫(kù)可用于病毒發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域。他們開(kāi)發(fā)了一種算法，可以檢測(cè)碰巧在魚(yú)血或組織樣本中的病毒DNA，并可用于識(shí)別不同物種的病毒。

新一代測(cè)序已經(jīng)徹底改變了基因組學(xué)研究，目前用于研究和理解遺傳物質(zhì)。它允許科學(xué)家從單個(gè)DNA中收集大量數(shù)據(jù)，然后將其整理成可公開(kāi)訪問(wèn)的巨大的在線基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。

牛津大學(xué)動(dòng)物學(xué)系研究員Aris Katzourakis博士和Amr Aswad博士最初偶然發(fā)現(xiàn)了數(shù)據(jù)庫(kù)的新用途。在靈長(zhǎng)類動(dòng)物中尋找古老的皰疹病毒時(shí)，他們發(fā)現(xiàn)了兩種新的無(wú)證病毒的證據(jù)。

在他們意外發(fā)現(xiàn)的刺激下，他們開(kāi)始考慮是否可以故意達(dá)到相同的效果。在另一個(gè)尋找新的魚(yú)類感染皰疹病毒的項(xiàng)目中，他們使用該技術(shù)檢測(cè)了50多種魚(yú)類基因組，以獲得可識(shí)別的病毒DNA。果然，除了他們期望找到的皰疹病毒外，研究人員還發(fā)現(xiàn)了一系列不同尋常的病毒 - 甚至可能是一個(gè)新的病毒家族。這些特征散布在15種不同魚(yú)類的碎片中，包括大西洋鮭魚(yú)和虹鱒魚(yú)。

為了確認(rèn)病毒證據(jù)不僅僅是僥幸或數(shù)據(jù)處理錯(cuò)誤，他們測(cè)試了當(dāng)?shù)爻泻蛪鬯静蛷d的額外樣品。在購(gòu)買(mǎi)的樣品中發(fā)現(xiàn)了相同的病毒片段。

研究作者，來(lái)自牛津大學(xué)動(dòng)物學(xué)系的Aris Katzourakis博士說(shuō)：“在鮭魚(yú)基因組中，我們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)完整獨(dú)立的病毒基因組，以及幾十個(gè)整合到魚(yú)類DNA中的病毒DNA片段。我們從最近的研究中了解到，病毒能夠整合到宿主的基因組中，有時(shí)會(huì)在那里保存數(shù)百萬(wàn)年。在這種情況下，看起來(lái)病毒可能通過(guò)竊取鮭魚(yú)本身的基因而獲得整合的能力。 ，它解釋了它如何在鮭魚(yú)基因組中如此普遍。“

這項(xiàng)研究成功的關(guān)鍵在于其跨學(xué)科方法，結(jié)合了兩個(gè)領(lǐng)域的技術(shù)：進(jìn)化生物學(xué)和基因組學(xué)。它們共同構(gòu)成了古代病理學(xué)新領(lǐng)域的核心 - 古代病毒的研究將DNA轉(zhuǎn)化為宿主，有時(shí)是數(shù)百萬(wàn)年前。使用的每種技術(shù)都被開(kāi)發(fā)用于分析大量的DNA序列數(shù)據(jù)。

牛津大學(xué)動(dòng)物學(xué)系和圣希爾達(dá)學(xué)院的共同作者和研究助理Amr Aswad博士說(shuō)：“發(fā)現(xiàn)新病毒歷來(lái)偏向于表現(xiàn)出疾病癥狀的人和動(dòng)物。但是，我們的研究顯示下一代有用DNA測(cè)序可以用于病毒鑒定。對(duì)許多人來(lái)說(shuō)，病毒DNA，例如黑猩猩或獵鷹數(shù)據(jù)是一種麻煩，一種流氓污染物需要從結(jié)果中過(guò)濾掉。但我們認(rèn)為這是一個(gè)等待被利用的機(jī)會(huì)，因?yàn)樗麄兛梢园ㄖ档醚芯康男虏《?- 正如我們?cè)谘芯恐邪l(fā)現(xiàn)的那樣。我們可能會(huì)拋棄非常有價(jià)值的數(shù)據(jù)。“

發(fā)現(xiàn)新病毒在歷史上并不是一個(gè)簡(jiǎn)單的過(guò)程。細(xì)胞不能自行生長(zhǎng)，因此必須在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)才能進(jìn)行分析，這需要數(shù)月的工作。但牛津大學(xué)的研究為未來(lái)提供了巨大的機(jī)遇。

除了這項(xiàng)研究之外，該方法還可用于識(shí)別一系列不同物種的病毒，特別是那些已知存在傳染性疾病的病毒。例如，蝙蝠和嚙齒動(dòng)物是傳染病的臭名昭著的載體，它們似乎對(duì)它們免疫。蚊子等昆蟲(chóng)也是傷害人類的病毒性疾病的攜帶者，如寨卡病毒。如果有效地應(yīng)用該方法可以在爆發(fā)甚至發(fā)生之前發(fā)現(xiàn)其他病毒。

Katzourakis博士補(bǔ)充說(shuō)：“與更傳統(tǒng)的病毒學(xué)方法相比，這種技術(shù)的真正優(yōu)勢(shì)之一是發(fā)現(xiàn)的速度，以及缺乏對(duì)識(shí)別患病個(gè)體的依賴。收集的病毒數(shù)據(jù)，否則可能被丟棄令人討厭的是，尋找致病和良性病毒的獨(dú)特資源，否則這些病毒將無(wú)法被發(fā)現(xiàn)。“

該團(tuán)隊(duì)接下來(lái)將開(kāi)始確定病毒的影響，以及它們是否對(duì)疾病或商業(yè)養(yǎng)魚(yú)有任何長(zhǎng)期影響。雖然感染性病毒可能不會(huì)在其天然宿主中引起疾病?? - 在這種情況下，魚(yú)類。存在跨物種傳播給養(yǎng)殖魚(yú)類或野生種群的風(fēng)險(xiǎn)。

然而，對(duì)人類的風(fēng)險(xiǎn)很小。Aris Katzourakis博士說(shuō)：“就這樣說(shuō)，我不會(huì)停止吃生魚(yú)片。”