在最小的動(dòng)物中基因組分析揭示了新物種和新屬
根據(jù)7月31日在邁克爾·艾特爾(Michael Eitel)的開放獲取期刊PLOS Biology上發(fā)表的一項(xiàng)新研究,顯然相同的海洋動(dòng)物稱為placozoans,一度被認(rèn)為屬于單一物種,它們的基因組實(shí)際上屬于不同的屬。德國慕尼黑Ludwig-Maximilians-Universität(LMU)的GertWörheide及其同事。他們使用的基因組方法可能適用于缺乏物理上不同特征的其他非常小的動(dòng)物群,包括螨蟲和線蟲。
Placozoans是一種長度為1毫米的海洋動(dòng)物,遍布世界各地的溫帶和熱帶水域。它們沒有有組織的組織,沒有神經(jīng)元,也沒有左右對稱性。由于沒有物理特征來區(qū)分不同的群體,它們直到現(xiàn)在被歸類為單一物種Trichoplax adhaerens。但是對單個(gè)基因的研究揭示了不同種群的placozoans中的顯著遺傳多樣性,表明它們可能在遺傳上存在分歧,盡管形態(tài)上保持相同。
為了探索這種可能性,作者對稱為H13的placozoan譜系的基因組進(jìn)行了測序,之前的研究表明,它與所謂的H1譜系遠(yuǎn)遠(yuǎn)相關(guān),后者的核基因組先前已被測序。它們進(jìn)行多級比較在一個(gè)所謂的“taxogenomics”的方法這兩個(gè)基因組之間的,包括基因的染色體內(nèi)的物理位置的對比,重復(fù)基因的分析,套官能比較基因,和跨門比較遺傳距離對各種分類水平的影響。
他們發(fā)現(xiàn)基因組的重排在H1和H13之間是常見的,并且基因重復(fù)(通常是適應(yīng)不同環(huán)境的基礎(chǔ))可能在分離兩組中起到重要作用。基于基因組差異的程度,作者提出將H13命名為Hoilungia hongkongensis,使其成為新的placozoans屬中的第一個(gè)物種。
“在原生動(dòng)物和其他小動(dòng)物中缺乏經(jīng)典的形態(tài)差異導(dǎo)致了它們在基因組水平上的分類學(xué)多樣性的低估,”Wörheide說。“我們的分析方法很可能有助于揭示其他類群的類似多樣性,這些類群缺乏形態(tài)上與眾不同的特征,如橈足類,輪蟲,螨蟲和線蟲。”
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