在人類微生物組中發(fā)現(xiàn)了100多種新的腸道細(xì)菌

從事腸道微生物組研究的科學(xué)家已經(jīng)從健康人的腸道中發(fā)現(xiàn)并分離出100多種全新的細(xì)菌。來(lái)自澳大利亞哈德森醫(yī)學(xué)研究所Wellcome Sanger研究所和EMBL歐洲生物信息學(xué)研究所的研究創(chuàng)造了迄今為止最全面的人體腸道細(xì)菌系列。這將有助于全世界的研究人員研究我們的微生物組如何保持我們的健康，以及它在疾病中的作用。

今天(2月4日)在Nature Biotechnology上報(bào)道，新資源將使科學(xué)家能夠比以往更準(zhǔn)確，更快地檢測(cè)人體腸道中存在的細(xì)菌。這也將為開(kāi)發(fā)治療諸如胃腸道疾病，感染和免疫疾病等疾病的新方法奠定基礎(chǔ)。

大約2%的人體重是由細(xì)菌引起的，腸道微生物組是一個(gè)主要的細(xì)菌部位，是人類健康的重要貢獻(xiàn)者。我們的腸道微生物組不平衡可能導(dǎo)致疾病和復(fù)雜的疾病，如炎癥性腸病，腸易激綜合征過(guò)敏和肥胖。然而，由于許多種腸道細(xì)菌在實(shí)驗(yàn)室中極難生長(zhǎng)，因此我們對(duì)它們的了解存在巨大差距。

在這項(xiàng)研究中，研究人員研究了來(lái)自英國(guó)和加拿大的20個(gè)人的糞便樣本，并成功地從這些樣本中生長(zhǎng)并對(duì)737個(gè)單獨(dú)的細(xì)菌菌株進(jìn)行DNA測(cè)序。對(duì)這些分離株的分析揭示了273種不同的細(xì)菌種類，包括173種以前從未測(cè)序過(guò)的細(xì)菌。其中，有105種甚至從未被分離過(guò)。

來(lái)自Wellcome Sanger研究所和澳大利亞哈德森醫(yī)學(xué)研究所的論文的第一作者Samuel Forster博士說(shuō)：“這項(xiàng)研究已經(jīng)創(chuàng)造了最大，最全面的人類健康相關(guān)腸道細(xì)菌公共數(shù)據(jù)庫(kù)。腸道微生物組在健康和疾病方面起著重要作用。這一重要資源將從根本上改變研究人員研究微生物組的方式。“

了解腸道微生物組如何影響人類健康的標(biāo)準(zhǔn)方法包括對(duì)來(lái)自腸道細(xì)菌混合樣本的DNA進(jìn)行測(cè)序，以試圖了解每種成分。然而，由于缺乏單獨(dú)分離的細(xì)菌和參考基因組，這些研究受到嚴(yán)重阻礙。

新的培養(yǎng)物收集和參考基因組將使研究人員更加便宜和容易地確定哪些細(xì)菌存在于人群中并研究它們?cè)诩膊≈械淖饔谩?/p>

來(lái)自EMBL歐洲生物信息學(xué)研究所的作者Rob Finn博士說(shuō)：“對(duì)于試圖找出人體微生物群中存在哪種細(xì)菌的研究人員來(lái)說(shuō)，純腸道菌株的參考基因組數(shù)據(jù)庫(kù)是至關(guān)重要的。然后，如果他們我想測(cè)試一個(gè)假設(shè)，例如某個(gè)特定物種在某種疾病中富集，如果這個(gè)物種看起來(lái)很重要，它們可以從分離物中獲取分離物并在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行物理測(cè)試。“

來(lái)自Wellcome Sanger研究所的資深作者Trevor Lawley博士說(shuō)：“這種單個(gè)細(xì)菌的培養(yǎng)物集合將成為基因和轉(zhuǎn)化微生物組研究的改變者。通過(guò)培養(yǎng)不成熟的細(xì)菌，我們創(chuàng)造了一種能夠進(jìn)行微生物組分析的資源。更快，更便宜，更準(zhǔn)確，并將進(jìn)一步研究其生物學(xué)和功能。最終，這將引導(dǎo)我們開(kāi)發(fā)新的診斷和治療疾病，如胃腸道疾病，感染和免疫狀況。

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