對(duì)狗基因組的分析將提供對(duì)人類疾病的洞察力
根據(jù)由基因組分析中心(TGAC)領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)新研究,犬類基因組的非編碼RNA是研究人類疾病的重要模型,是進(jìn)化和生物醫(yī)學(xué)研究的重要起點(diǎn)。今天在PLOS ONE上發(fā)表的一項(xiàng)新研究揭示了狗基因組中microRNAs的改進(jìn)注釋,以進(jìn)一步了解其生物學(xué)作用。為將來研究生物醫(yī)學(xué),進(jìn)化和重要?jiǎng)游?包括狗,牛,馬和豬)的馴化提供平臺(tái)。
微小RNA(miRNA)是小的非編碼RNA分子,其在調(diào)節(jié)動(dòng)物和植物中的基因表達(dá)中起關(guān)鍵作用。使用最新的狗基因組裝配和九種不同狗組織的小RNA序列,包括皮膚,血液,卵巢和睪丸,來自TGAC的科學(xué)家已經(jīng)鑒定出91種新型miRNA。
這一發(fā)現(xiàn)提供了一個(gè)重要的機(jī)會(huì),不僅可以增強(qiáng)我們對(duì)miRNA如何調(diào)節(jié)用于研究人類疾病的重要模型物種中的各種生物過程的理解,而且可以導(dǎo)致進(jìn)一步的類似研究miRNA在動(dòng)物馴化中的作用。來自TGAC脊椎動(dòng)物和健康基因組學(xué)的首席研究員Luca Penso Dolfin博士說:“由于miRNA在編排各種細(xì)胞過程中非常重要,因此發(fā)現(xiàn)這91種新型miRNA是探索其潛在重大影響的重要起點(diǎn)?;蛘{(diào)控。“
總體而言,Penso-Dolfin博士分析了811個(gè)miRNA:91個(gè)新的microRNA序列和720個(gè)保守的(即,對(duì)其他生物共有)。在這些保守的基因座中,207個(gè)先前未被鑒定為犬microRNA。
Penso-Dolfin博士補(bǔ)充說:“我們的結(jié)果代表了我們對(duì)狗基因組知識(shí)的明顯改善,為進(jìn)一步研究基因調(diào)控的進(jìn)化以及microRNA對(duì)病理狀況的貢獻(xiàn)鋪平了道路。我們現(xiàn)在正在尋找額外的狗和各種農(nóng)場(chǎng)動(dòng)物的數(shù)據(jù),將microRNA發(fā)現(xiàn)與其在馴化中可能發(fā)揮的作用的研究結(jié)合起來。“
家犬Canis familiaris是狼(Canis lupus)馴化的結(jié)果,它起源于大約1萬年前。從那以后,人工選擇了數(shù)百種犬種,導(dǎo)致形態(tài)和行為變異程度非常高。自從狗出現(xiàn)以來,它與人類共享環(huán)境,已經(jīng)暴露于類似的病原體,因此代表了人類疾病研究的重要模型系統(tǒng)。
最新的Canine基因組構(gòu)建和注釋的發(fā)布,CanFam3.1提供了一個(gè)機(jī)會(huì),可以增強(qiáng)我們對(duì)狗模型系統(tǒng)中組織間基因調(diào)控的理解。
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