研究人員對(duì)大山雀的基因組進(jìn)行序列化
由荷蘭生態(tài)學(xué)研究所的Veronika Laine博士和來(lái)自瓦赫寧根大學(xué)的Martien Groenen博士領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)對(duì)一只著名的鳴禽(Parus major)的基因組進(jìn)行了測(cè)序和組裝
來(lái)自美國(guó),歐洲和日本的Laine博士,Groenen博士及其同事從荷蘭最近的圈養(yǎng)人群 - 四代人工飼養(yǎng) - 中選擇了一只雄性大山雀進(jìn)行基因組測(cè)序和組裝。
為了進(jìn)一步了解該物種的進(jìn)化遺傳學(xué),他們還對(duì)來(lái)自歐洲各地的另外29名野生個(gè)體的全基因組進(jìn)行了測(cè)序。
“50多年來(lái),大山雀一直是進(jìn)化,生態(tài)和行為研究研究的典范;特別是學(xué)習(xí)和認(rèn)知已被深入研究,“科學(xué)家們解釋說(shuō)。
“為了進(jìn)一步深入了解這些重要特征背后的分子機(jī)制,我們重新組裝了一個(gè)偉大的山雀參考基因組,全基因組重新排序來(lái)自歐洲各地的另外29個(gè)人。”
除了觀察偉大的山雀基因組,該團(tuán)隊(duì)還通過(guò)在參考鳥的大腦和血液組織中進(jìn)行全基因組測(cè)序來(lái)研究DNA甲基化模式。
科學(xué)家們解釋說(shuō):“甲基化屬于表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域 - 研究你可以繼承的內(nèi)容,而不是基于你的基因。”
“基因組中的特定DNA序列可被甲基化:向其中加入甲基,改變基因的功能。”
“這使我們能夠確定在最近的鳥類進(jìn)化過(guò)程中一直在選擇的大山雀基因組中的區(qū)域。”
對(duì)于與學(xué)習(xí)和認(rèn)知相關(guān)的基因,這些區(qū)域似乎過(guò)多。
荷蘭生態(tài)學(xué)研究所的團(tuán)隊(duì)成員Kees van Oers博士說(shuō):“偉大的山雀已經(jīng)發(fā)展成為聰明,非常聰明的人。”
“這不是你的普通鳥類,因?yàn)樗趯W(xué)習(xí)新行為方面屬于前3%最聰明的鳥類。這使它成為研究學(xué)習(xí),記憶和認(rèn)知過(guò)程演變的理想候選者。“
“研究揭示的是那些相同區(qū)域的所謂保守甲基化模式,不僅存在于鳥類中,還存在于人類和其他哺乳動(dòng)物中。”
這表明甲基化等表觀遺傳過(guò)程與分子進(jìn)化速度之間存在相關(guān)性:“甲基化越多,進(jìn)化越多”。
這項(xiàng)研究結(jié)果發(fā)表在的1月25日發(fā)行雜志自然通訊小號(hào)。
“我們的研究增加了越來(lái)越多的代表性基因組在整個(gè)鳥類家譜中的測(cè)序,”研究人員說(shuō)。
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