單細(xì)胞測(cè)序揭示了肺腫瘤中骨髓細(xì)胞的景觀
最近出現(xiàn)的免疫療法標(biāo)志著對(duì)許多癌癥的研究和護(hù)理發(fā)生了翻天覆地的變化,給世界各地的患者和家庭帶來(lái)了新的希望。對(duì)于那些對(duì)治療有反應(yīng)的人來(lái)說(shuō),結(jié)果可能是戲劇性的。激活患者的免疫系統(tǒng)對(duì)抗癌癥可以殺死或縮小腫瘤,并且在某些情況下,導(dǎo)致完全緩解。
盡管取得了重大進(jìn)展,但只有少數(shù)人從免疫療法中受益,其原因仍不明確。
免疫療法研究主要集中在T細(xì)胞上,T細(xì)胞是一種學(xué)習(xí)識(shí)別特定蛋白質(zhì)并發(fā)動(dòng)攻擊的免疫細(xì)胞。然而,腫瘤是許多不同細(xì)胞類型的復(fù)雜混合物,包括統(tǒng)稱為腫瘤浸潤(rùn)性骨髓細(xì)胞的其他免疫細(xì)胞。這些細(xì)胞代表免疫療法的替代目標(biāo),但它們?cè)谀[瘤中的作用仍然知之甚少。
為了揭示這個(gè)未經(jīng)檢查的免疫細(xì)胞家族,哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員在布拉瓦特尼克研究所,馬薩諸塞州總醫(yī)院,貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心和布萊根婦女醫(yī)院使用單細(xì)胞測(cè)序來(lái)繪制骨髓細(xì)胞的景觀。來(lái)自肺癌患者的腫瘤。
他們的研究于4月9日在線發(fā)表在Immunity上,揭示了25個(gè)骨髓細(xì)胞亞群,其中許多先前未被描述,具有不同的基因表達(dá)特征,這些特征在患者中是一致的。這些亞群中的大多數(shù)也在肺癌的小鼠模型中被鑒定,表明跨物種的骨髓細(xì)胞的高度相似性。
這組作者說(shuō),這些發(fā)現(xiàn)為未來(lái)研究奠定了基礎(chǔ),可以解釋骨髓細(xì)胞在癌癥中的確切作用,并評(píng)估它們作為新的或改進(jìn)的免疫療法靶點(diǎn)的潛力。
“免疫療法顯然是癌癥治療的轉(zhuǎn)變方法,但有許多患者沒(méi)有反應(yīng),問(wèn)題是為什么,”共同通訊作者,HMS系統(tǒng)生物學(xué)助理教授Allon Klein說(shuō)。
“部分答案肯定在于骨髓細(xì)胞水平,與腫瘤細(xì)胞和T細(xì)胞嚴(yán)重相互作用,”Klein繼續(xù)說(shuō)道。“通過(guò)識(shí)別腫瘤中骨髓細(xì)胞狀態(tài)的豐富復(fù)雜性,我們現(xiàn)在有了一個(gè)強(qiáng)大的起點(diǎn),可以更好地了解它們的功能和臨床應(yīng)用。”
作者說(shuō),特別重要的是,發(fā)現(xiàn)骨髓亞群可以在不同的人類患者和小鼠中得到可靠的鑒定 - 這一觀察結(jié)果強(qiáng)調(diào)了小鼠模型在免疫治療研究中的基本用途。
“所分析的每位患者的腫瘤細(xì)胞不同,但腫瘤浸潤(rùn)性骨髓細(xì)胞的特征在同一患者之間大大重疊。此外,許多骨髓細(xì)胞群在患者和小鼠中都非常保守,”共同作者M(jìn)ikael Pittet,HMS表示。 Mass General放射學(xué)副教授。
“這是令人興奮的,因?yàn)樵絹?lái)越多的基于小鼠研究的證據(jù)表明骨髓細(xì)胞可以控制癌癥進(jìn)展并影響幾乎所有類型的癌癥治療,包括免疫療法”Pittet補(bǔ)充說(shuō)。
一致的復(fù)雜性
骨髓細(xì)胞 - 由免疫細(xì)胞組成,包括單核細(xì)胞,巨噬細(xì)胞,樹(shù)突細(xì)胞和粒細(xì)胞 - 是先天免疫系統(tǒng)的一部分,是人體對(duì)抗外來(lái)病原體的第一道防線。它們?cè)诩せ钸m應(yīng)性免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用,包括可以精確靶向和破壞病原體的T細(xì)胞。
為了更好地了解腫瘤中骨髓細(xì)胞的多樣性,Pittet與Klein合作,他領(lǐng)導(dǎo)了InDrops的開(kāi)發(fā),InDrops是單細(xì)胞基因表達(dá)分析的關(guān)鍵技術(shù)。在目前的研究中,Pittet,Klein及其同事將這項(xiàng)技術(shù)應(yīng)用于一小組患者和非小細(xì)胞肺癌小鼠的腫瘤??傊?,他們從超過(guò)56,000個(gè)單個(gè)細(xì)胞中收集基因表達(dá)數(shù)據(jù),每次一個(gè)細(xì)胞。
他們發(fā)現(xiàn),例如Pittet及其同事發(fā)現(xiàn)的樹(shù)突狀細(xì)胞對(duì)小鼠成功進(jìn)行抗PD-1免疫治療至關(guān)重要 - 含有四種不同的亞型,這些亞型主要反映在人類和小鼠之間。單核細(xì)胞亞型在人和小鼠之間也很好地匹配,而巨噬細(xì)胞是保守的并且根據(jù)物種而變化。他們的分析顯示骨髓細(xì)胞基因表達(dá)特征分為25個(gè)不同的簇,大大擴(kuò)展了已知骨髓細(xì)胞狀態(tài)的數(shù)量。
中性粒細(xì)胞是哺乳動(dòng)物中最豐富的白細(xì)胞,在人類和小鼠中形成了五種相似亞型的光譜,其中一個(gè)亞型是獨(dú)特的。Pittet先前與Klein合作,發(fā)現(xiàn)表達(dá)高水平基因Siglecf的中性粒細(xì)胞具有促進(jìn)腫瘤的特性。新的分析證實(shí)了這一發(fā)現(xiàn),表明這些中性粒細(xì)胞在腫瘤中高度富集。
“骨髓細(xì)胞群是復(fù)雜的,但我們看到患者和物種的復(fù)雜性相同,這使我們相信小鼠模型中的見(jiàn)解可以轉(zhuǎn)化為人類,”Pittet說(shuō),他是群眾中心癌癥免疫學(xué)計(jì)劃的主任用于系統(tǒng)生物學(xué)。
“現(xiàn)在我們已經(jīng)擁有了這個(gè)顆粒狀的景觀,我們可以更好地設(shè)計(jì)研究來(lái)評(píng)估獨(dú)特亞群在腫瘤進(jìn)展中的作用,并尋找操縱特定細(xì)胞的方法,以期使免疫療法更有效,”Pittet補(bǔ)充說(shuō)。
例如,通過(guò)繪制骨髓細(xì)胞基因表達(dá)模式的景觀,科學(xué)家們可以挖掘已知臨床結(jié)果的患者的現(xiàn)有數(shù)據(jù)集,以尋找特定的骨髓細(xì)胞群的存在并評(píng)估它們與患者存活的關(guān)系。
Klein,Pittet及其同事在他們的研究中檢驗(yàn)了這種方法的可行性,并找到了有希望的候選者,但需要更大的患者樣本量才能得出確鑿的結(jié)果。為此,他們與Brigham and Women's的HMS外科教授Raphael Bueno和Beth Israel Deaconess的HMS醫(yī)學(xué)講師Elena Levantini合作,他們正在研究肺癌標(biāo)本中與患者生存相關(guān)的因素。
“在美國(guó),肺癌仍然是一種常見(jiàn)的致命性惡性腫瘤,這項(xiàng)重要的合作努力為肺癌患者開(kāi)發(fā)個(gè)性化療法提供了新的線索和方向,而且沒(méi)有其他良好的治療選擇,”該部門(mén)負(fù)責(zé)人布埃諾說(shuō)。胸部外科和弗雷德里克·萊文在布里格姆和婦女的胸外科和肺癌研究中的杰出主席。
研究小組還研究了腫瘤中骨髓細(xì)胞的行為是否可以通過(guò)采集血液中循環(huán)的骨髓細(xì)胞來(lái)收集,并發(fā)現(xiàn)兩者之間的關(guān)系不佳。
除了即時(shí)的基礎(chǔ)和轉(zhuǎn)化研究機(jī)會(huì)外,研究結(jié)果還為人類腫瘤圖譜等計(jì)劃的工作提供了信息,該計(jì)劃旨在繪制人體內(nèi)所有細(xì)胞類型的景觀,以及人類腫瘤圖譜網(wǎng)絡(luò)。在細(xì)胞和分子細(xì)節(jié)中創(chuàng)建各種癌癥類型的地圖集。
“這項(xiàng)工作適用于生物醫(yī)學(xué)的許多領(lǐng)域,特別是免疫學(xué)領(lǐng)域的單細(xì)胞革命,”克萊因說(shuō)。“為了改善免疫療法,我們需要盡可能多地了解所涉及的細(xì)胞和過(guò)程。這需要真正的團(tuán)隊(duì)努力,如果沒(méi)有整個(gè)醫(yī)學(xué)院的精彩合作,我們的研究是不可能的。”
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