三文魚基因組合作發(fā)表在Nature上
SFU教授Willie Davidson是國際研究團(tuán)隊的一員,為基因組進(jìn)化提供了新的視角。研究人員建立了大西洋鮭魚基因組的“人類”質(zhì)量序列,現(xiàn)在可以在線獲得。他們的作品已在著名的自然雜志上發(fā)表。據(jù)研究人員稱,大西洋鮭魚基因組大小為2.97千兆堿基,在29條染色體上含有37,000個基因,其大小與人類基因組相似。這項最新工作意味著為人類開發(fā)的技術(shù)可應(yīng)用于世界各地的野生和養(yǎng)殖鮭魚。
“大西洋鮭魚的基因組已經(jīng)能夠?qū)琪V魚基因組進(jìn)行改進(jìn),并為其他鮭魚的基因組測序和組裝提供了框架,例如Coho鮭魚和北極紅點鮭,”SFU分子生物學(xué)系教授Davidson說。和生物化學(xué)。“大西洋鮭魚基因組的完成使這個物種能夠在馴養(yǎng)動物(例如牛,羊,豬,雞)旁邊占據(jù)一席之地,這些動物的基因組正常用于增強牲畜生產(chǎn)。”
該團(tuán)隊描述了一個全基因組復(fù)制(WGD)事件或突變,發(fā)生在8000萬年前,鮭魚系列中的第四個,并研究了鮭科魚類基因加倍的獨特能力的影響,使它們能夠大大擴(kuò)展基因與環(huán)境的相互作用。
雖然他們發(fā)現(xiàn)鮭魚基因組在一段基因組不穩(wěn)定之后又回到了原始階段,但今天仍然存在一些重復(fù)的痕跡。“大西洋鮭魚基因組提供了對紅倍體化的見解”是Davidson與維多利亞大學(xué)Ben Koop博士合作的結(jié)果,該項目是加拿大,智利和挪威專家參與的國際項目的一部分。該項目得到了大西洋鮭魚基因組序列國際合作組織(ICSASG)的支持。
該研究提供了參考基因組序列和基因圖譜,為70多種經(jīng)濟(jì),文化和環(huán)境重要的鮭魚物種提供了一個全新的科學(xué)基線,可用于改進(jìn)和理解漁業(yè),保護(hù),生態(tài)學(xué),生理學(xué),進(jìn)化和水產(chǎn)養(yǎng)殖。
已發(fā)表的研究報告確保只需點擊鼠標(biāo)即可獲得鮭魚基因以及可持續(xù)農(nóng)業(yè)和野生鮭魚管理的機(jī)會。
“該出版物證明了ICSASG的成功合作關(guān)系:他們揭開了該物種基因組的極端復(fù)雜性,產(chǎn)生了大量新知識并解決了許多技術(shù)障礙”,英國Genome公司總裁兼首席執(zhí)行官Alan Winter博士說。哥倫比亞。“此次合作留下了一項遺產(chǎn),將有利于加拿大,挪威,智利和其他國家未來幾年對這一經(jīng)濟(jì)和環(huán)境重要物種的研究和可持續(xù)發(fā)展。”
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