四個新發(fā)現(xiàn)的基因可以改善水稻
日本的一個研究小組已經(jīng)將一種用于人類遺傳分析的方法應(yīng)用于水稻,并迅速發(fā)現(xiàn)了四種對農(nóng)業(yè)具有潛在重要意義的新基因。這些發(fā)現(xiàn)可能會影響作物育種,并有助于解決人口增長造成的糧食短缺問題。該論文于2016年6月21日(日本標(biāo)準(zhǔn)時間)在Nature Genetics的在線版上發(fā)表?;谥参镞z傳和育種的選擇性作物改良對于支持世界不斷增長的人口至關(guān)重要。為了有效地培育新的作物品種,有必要快速鑒定與高作物產(chǎn)量相關(guān)的基因,并分析使它們變得特殊的原因。
到目前為止,作物的遺傳分析主要基于數(shù)量性狀基因座(QTL)分析,但這種方法需要時間來開發(fā)實(shí)驗(yàn)種群。另一種被稱為全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)的方法,經(jīng)常用于分析人類基因,使用來自許多現(xiàn)存?zhèn)€體的數(shù)據(jù)在短時間內(nèi)分析基因。使用這種方法也分析了各種植物物種,但很少有成功分析的案例。
為了使用GWAS分析產(chǎn)生結(jié)果,研究小組將其目標(biāo)限制在176個日本水稻品種,其中包括神戶大學(xué)多年來一直保持的日本釀酒釀造中使用的86個品種。使用新一代測序,該組確定了每個品種的全部序列,并發(fā)現(xiàn)了總共493,881個基于DNA的多態(tài)性。
基于這些結(jié)果,該團(tuán)隊對每種性狀進(jìn)行了GWAS分析,并在一組12個水稻植物染色體中快速鑒定出4個基因。染色體1含有決定水稻開花日期的基因; 4號染色體含有影響產(chǎn)穗數(shù),葉寬和稻粒數(shù)的基因; 8號染色體基因影響芒長(影響收獲的因素); 11號染色體內(nèi)的基因決定開花日期,株高和穗長。
基于GWAS的植物遺傳分析已經(jīng)進(jìn)行了多次,但成效有限。該實(shí)驗(yàn)的成功可以幫助發(fā)現(xiàn)其他植物和動物物種中的基因,并可能有助于解決人口增長造成的糧食短缺問題。由神戶大學(xué)維護(hù)并用于本研究的日本水稻品種可用作有價值的遺傳資源,以幫助鑒定其他基因和培育新的作物品種。
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