新工具使研究人員能夠快速操縱哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的蛋白質(zhì)水平
由西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院(ISMMS)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的研究小組開發(fā)了一種工具,使科學(xué)家能夠快速操縱同一細(xì)胞中兩種蛋白質(zhì)的水平。他們說這種被稱為“雙分子調(diào)諧器”的方法提供了一種在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中進(jìn)行深入分析的簡便方法,特別是干細(xì)胞。
他們的研究發(fā)表在5月27日的Nature Communications上,它使用兩種植物激素靶向特定蛋白質(zhì)進(jìn)行降解,從而使研究人員能夠?qū)⑦@些蛋白質(zhì)降低到他們選擇的水平。這個(gè)過程在幾分鐘內(nèi)完成,使科學(xué)家們能夠監(jiān)測細(xì)胞中這些蛋白質(zhì)耗盡時(shí)發(fā)生的情況。
“例如,我們可以監(jiān)測細(xì)胞周期的差異,這取決于一種或另一種蛋白質(zhì)的消耗情況,因?yàn)檫@種工具的作用非常迅速且有效,”該研究的高級研究員Ran Brosh博士說,他是實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員。該研究的相應(yīng)作者,Ihor R. Lemischka博士,ISMMS的藥理學(xué),發(fā)育和再生生物學(xué)教授。
Brosh博士說,研究人員不僅可以選擇一種或兩種選擇的蛋白質(zhì)中的多少可以被降解,整個(gè)過程是可逆的。“功能喪失研究是理解基因如何工作的關(guān)鍵,但快速有效地干擾哺乳動(dòng)物基因功能的方法 - 特別是干細(xì)胞 - 很少。這種雙分子調(diào)諧器,你可以獨(dú)立操作兩種蛋白質(zhì)另外,對于迄今為止難以進(jìn)行的各種研究非常有用,例如解碼信號網(wǎng)絡(luò)或蛋白質(zhì)相互作用,“他說。
調(diào)諧器可以用于兩種蛋白質(zhì),因?yàn)檠芯咳藛T已經(jīng)確定了兩種植物激素,這些激素有助于指示細(xì)胞對正在研究的蛋白質(zhì)的靶向破壞。
激素是生長素和coronatine,植物激素茉莉酸的細(xì)菌類似物,兩者都調(diào)節(jié)植物生理,但對人類完全無毒 - “我們每天在蔬菜和沙拉中食用這些激素,”Brosh博士說。
該系統(tǒng)的工作方式是研究人員使用傳統(tǒng)的基因沉默技術(shù)沉默感興趣的基因或基因,同時(shí)以他們可以控制的形式提供相同的基因。這些基因現(xiàn)在含有產(chǎn)生稱為degron的短肽的序列 - 其功能是調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)降解 - 與編碼的蛋白質(zhì)融合。
引入的第三種成分(所有三種都包含在單一的慢病毒載體中)是植物激素的受體。當(dāng)用激素處理細(xì)胞時(shí),它結(jié)合其受體,然后靶向蛋白質(zhì) -缺失融合體進(jìn)行破壞。“我們的調(diào)諧器允許研究人員利用電池的降解系統(tǒng),我們可以按照我們的意愿將其調(diào)高或調(diào)低 - 例如調(diào)光燈一點(diǎn)點(diǎn)或全部,”Brosh博士說。
他補(bǔ)充說,與其他基因編輯技術(shù)(可能需要數(shù)月才能應(yīng)用于單一基因)不同,建立雙調(diào)諧器需要一到兩周的實(shí)驗(yàn)室工作。
Brosh博士補(bǔ)充說,雖然該工具適用于研究,但它可以具有臨床應(yīng)用,例如篩查藥物靶標(biāo)。
合作者包括來自華盛頓大學(xué)的研究人員,該研究人員還與ISMMS共享專利,用于開發(fā)冠狀病毒作為研究工具。
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